综述：探索口腔微生物组：从传统技术到先进的组学研究和数据库

《Antonie van Leeuwenhoek》：Exploring the oral microbiome: from traditional techniques to advanced omics and databases

　　

摘要

口腔微生物组是指对口腔内微生物的研究。组学、分子生物学和生物信息学方法在研究口腔微生物组的多样性、组成和功能方面发挥着重要作用。尤其是16S和18S rRNA测序等分子技术，极大地推动了口腔微生物组的研究进展。通过分析口腔样本中的16S rRNA基因序列，可以全面了解口腔微生物组的物种构成，包括已存在的和新的细菌种类。该方法对于检测与龋齿、牙周病和口腔恶性肿瘤相关的细菌病原体具有重要意义。与此同时，18S rRNA基因测序还能提供有关口腔微生物组中真菌和原生生物组成的信息，这些微生物对口腔健康也起着重要作用。该技术还能识别可能导致口腔健康问题的寄生虫感染。组学工具是指利用高通量方法大规模研究各种生物分子的技术。将这些技术应用于口腔微生物组，研究人员能够确定口腔内微生物的遗传、转录组、蛋白质组和代谢组特征。这些工具有助于全面了解口腔微生物组的组成、功能及其相互作用。目前有许多数据库提供了关于口腔微生物组的有用信息，这些数据库存储了关于口腔内微生物群落的相关数据，有助于研究人员探索其多样性、组成和功能特点。例如人类口腔微生物组数据库（HOMD）和口腔微生物组数据库（OMD）等。在这篇简短的综述中，我们介绍了用于研究口腔微生物组的多种分子生物学和组学工具及数据库。