综述：蜱传顶复门寄生虫的下一代测序技术：以泰勒虫（Theileria）和巴贝斯虫（Babesia）为例的系统综述

《Tropical Animal Health and Production》：Next-generation sequencing in tick-borne apicomplexan parasites: approaches for Theileria and Babesia, a systematic review

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摘要

背景

蜱传的顶复门寄生虫对牲畜健康和人类生命构成了威胁，这凸显了寄生虫在“同一健康”框架中的重要性。测序技术的进步为我们提供了关于寄生虫多样性、遗传组成和行为的重要见解，有助于改进预防和控制策略。本综述综合了应用于Theileria和Babesia的测序方法，强调了不断发展的技术如何重塑我们对寄生虫变异和基因功能的理解。

方法

本研究使用了五个数据库进行系统分析：Wiley Online Library、ScienceDirect、SpringerLink、PubMed以及非洲在线期刊（AJOL）和Google Scholar。采用了Joanna Briggs研究所的批判性评估 checklist来管理数据偏差，PRISMA指南的流程图总结了数据选择标准。

结果

共汇总了127篇论文（发表于1995年至2025年间），这是首次系统性地整合Theileria和Babesia的测序方法。该综述重点介绍了三种用于测序的样本采集方法：感染宿主组织、寄生虫培养以及蜱虫采样。诸如Oxford Nanopore这样的新兴测序技术为直接RNA测序提供了有力工具，补充了现有的平台。测序技术的进步揭示了高度变异的基因区域，这些区域对于提高变异检测能力、加强监测以及发现疫苗靶点具有重要意义。全基因组测序和转录组测序揭示了对宿主特异性和寄生虫生存至关重要的基因家族，为牲畜和人类健康领域的寄生虫控制策略提供了潜在靶点；同时，对旧基因组的重新组装提高了遗传变异的分辨能力。

结论

基因组测序技术的进步增强了我们对寄生虫生物学的理解，并改变了寄生虫的检测、监测和疫苗开发方式。

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背景

蜱传的顶复门寄生虫对牲畜健康和人类生命构成了威胁，这凸显了寄生虫在“同一健康”框架中的重要性。测序技术的进步为我们提供了关于寄生虫多样性、遗传组成和行为的重要见解，有助于改进预防和控制策略。本综述综合了应用于Theileria和Babesia的测序方法，强调了不断发展的技术如何重塑我们对寄生虫变异和基因功能的理解。

方法

本研究使用了五个数据库进行系统分析：Wiley Online Library、ScienceDirect、SpringerLink、PubMed以及非洲在线期刊（AJOL）和Google Scholar。采用了Joanna Briggs研究所的批判性评估 checklist来管理数据偏差，PRISMA指南的流程图总结了数据选择标准。

结果

共汇总了127篇论文（发表于1995年至2025年间），这是首次系统性地整合Theileria和Babesia的测序方法。该综述重点介绍了三种用于测序的样本采集方法：感染宿主组织、寄生虫培养以及蜱虫采样。诸如Oxford Nanopore这样的新兴测序技术为直接RNA测序提供了有力工具，补充了现有的平台。测序技术的进步揭示了高度变异的基因区域，这些区域对于提高变异检测能力、加强监测以及发现疫苗靶点具有重要意义。全基因组测序和转录组测序揭示了对宿主特异性和寄生虫生存至关重要的基因家族，为牲畜和人类健康领域的寄生虫控制策略提供了潜在靶点；同时，对旧基因组的重新组装提高了遗传变异的分辨能力。

结论

基因组测序技术的进步增强了我们对寄生虫生物学的理解，并改变了寄生虫的检测、监测和疫苗开发方式。

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