大麦响应白粉病过程中，ATAC-Seq技术揭示的表观遗传染色质重塑机制

《Scientific Data》：Epistatic chromatin remodeling during barley response to powdery mildew by ATAC-Seq

　　

摘要

了解植物与病原体相互作用的分子基础对于推进作物保护策略至关重要。由专性真菌病原体Blumeria hordei（简称Bh）引起的白粉病对全球大麦生产构成了威胁。我们利用感染了Bh的大麦及其免疫突变体的时间序列ATAC-Seq数据分析，探讨了由mildew locus a6（简称Mla6）和Blufensin1（简称Bln1）这两种基因相互作用所影响的染色质可及性。Mla6编码一种核苷酸结合型亮氨酸丰富重复序列（NLR）免疫受体，而Bln1则是一种基础防御调控因子。在接种后0小时、16小时、20小时和32小时进行采样，分别捕捉到了病原体入侵和菌丝体发育的关键阶段。通过对ATAC-Seq数据生成通用统计指标并与配对的RNA-Seq数据进行对比，验证了数据集的有效性。ATAC-Seq与RNA-Seq的结果呈现相关性，尤其凸显了染色质介导的表观遗传相互作用，表明该数据集能够帮助人们深入了解染色质的调控结构。这些结果为解析参与大麦免疫反应的转录网络提供了宝贵的研究资料。

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