一项综合分析揭示了IFITM2在胃癌发生和进展中的作用

《Scientific Reports》：An integrative analysis revealing involvement of IFITM2 in gastric cancer initiation and progression

　　

摘要

识别胃癌（GC）的潜在预后生物标志物和治疗靶点仍然至关重要。我们进行了综合分析，利用了来自GEO数据库的早期胃癌单细胞转录组数据以及UCSC数据中心的DNA甲基化数据，来筛选早期胃癌中失调的基因。研究结果表明，IFITM2在早期胃癌上皮细胞中的表达上调，其启动子区域的甲基化水平下调。在TCGA患者的胃癌细胞系和胃癌组织中进一步证实了IFITM2水平的升高。根据TCGA数据库的数据，IFITM2水平的高低与胃癌患者的不良预后相关。通过对35个胃癌细胞系进行的Depmap单基因CRISPR敲除实验以及体内siRNA介导的IFITM2敲低实验均表明，IFITM2的沉默能够抑制细胞增殖。GSEA分析显示，高水平的IFITM2与NF-κB介导的TNFα信号通路相关。此外，STRING蛋白-蛋白相互作用分析提示IFITM2与NF-κB之间存在功能联系。最后，IFITM2的沉默显著抑制了NF-κB的活性及其靶基因的表达，这些靶基因包括抗凋亡基因BCL-2、BCL-XL、促增殖基因TNFα、CCL2和CDK1以及促转移基因COX-2。因此，我们的研究表明IFITM2可能通过激活NF-κB信号通路促进胃癌的发生和增殖，从而将其视为胃癌的预后生物标志物和治疗靶点。