利用免疫信息学和分子模拟方法设计针对基孔肯雅病毒的多表位亚单位疫苗

《Scientific Reports》：Designing a multi-epitope subunit vaccine against chikungunya virus using immunoinformatics and molecular simulation approaches

　　

摘要

基孔肯雅热是一种由蚊子传播的病毒性疾病，会导致感染率上升并引发严重的公共卫生问题，但目前尚无获批的疫苗。本研究采用了免疫信息学和结构疫苗学的综合方法，开发出一种具有前景的多表位亚单位疫苗候选物。研究重点关注了保守的结构多蛋白（NP_690589），以进行表位预测。经过严格筛选，选出了9个CTL表位、8个HTL表位和5个B细胞表位（这些表位具有高抗原性、安全性以及超过90%的保守性）。最终设计的疫苗配方中加入了β-防御素-3作为佐剂，该疫苗表现出良好的理化特性、较强的抗原性（评分0.7317），预计全球覆盖率为91.79%。分子对接实验显示该疫苗能与人类TLR4和TLR2紧密结合，而100纳秒的分子动力学模拟进一步证实了这一点。免疫模拟研究表明该疫苗能够增强先天性和适应性免疫反应。为了在大肠杆菌中高效表达，还对相关密码子进行了优化。所提出疫苗的mRNA在体内条件下表现出稳定性。这种基于计算机模拟设计的疫苗候选物具有高度免疫原性、物理稳定性以及广泛的保护作用，是一个很有潜力的候选疫苗，目前需要通过实验验证才能进入临床前测试阶段。