基于生物信息学的分析方法，揭示了与PANoptosis（程序性细胞死亡）相关的分子亚型以及儿童急性髓系白血病中肿瘤免疫微环境的异质性

《Annals of Hematology》：Bioinformatics-driven dissection of PANoptosis-related molecular subtypes and tumor immune microenvironment heterogeneity in pediatric acute myeloid leukemia

　　

摘要

PANoptosis是一种综合性的程序性细胞死亡机制，包括凋亡（apoptosis）、坏死性凋亡（necroptosis）和焦亡（pyroptosis），对肿瘤的免疫监视和免疫逃逸具有多方面的影响。然而，儿童急性髓系白血病（AML）中PANoptosis的分子机制仍不明确。在此，我们对TARGET数据库中的AML骨髓转录组数据进行了生物信息学分析，旨在确定与PANoptosis相关的分子亚型，表征肿瘤免疫微环境（TIME）的异质性，并识别潜在的调控基因和小分子结合物。我们发现了68个与PANoptosis相关的基因，并通过无监督聚类方法将它们分为四种具有不同临床结局和TIME特征的分子亚型（C1–C4）。C2亚型表现出强烈的CD8?细胞毒性T细胞和自然杀伤（NK）细胞活性，这与良好的预后相关；而C1亚型则表现出免疫抑制和较差的生存率。我们发现了一组IGF1–CCL2–CCL4基因，这些基因与PANoptosis的调控有关，并且在Toll样受体信号通路中富集。计算机模拟分子对接显示SB216763可能是这些靶点的候选配体，但这需要实验验证。我们的发现揭示了儿童AML中PANoptosis的异质性，并为未来的机制研究和转化研究提供了分层框架。