《Plant Science》:Development of tomatoes with high sugar and GABA accumulation and parthenocarpic traits by introducing mutations in HWS and GAD3
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崔承哲(Seungje Choi)|岩间武(Takeru Iwama)|小林美咲(Misaki Kobayashi)|江村宏(Hiroshi Ezura)|三浦健二(Kenji Miura)日本筑波大学生命与地球科学系毕业摘要番茄是全球重要的农作物,富含多种营养成分,包括维生素、
崔承哲(Seungje Choi)|岩间武(Takeru Iwama)|小林美咲(Misaki Kobayashi)|江村宏(Hiroshi Ezura)|三浦健二(Kenji Miura)
日本筑波大学生命与地球科学系毕业
摘要
番茄是全球重要的农作物,富含多种营养成分,包括维生素、番茄红素和γ-氨基丁酸(GABA)。本研究利用CRISPR/Cas9技术对两个基因HWS(Hawaiian Skirt)和GAD3(谷氨酸脱羧酶3)进行突变处理,以提高番茄品质、增强产量稳定性并改善单性结实特性。实验结果表明,HWS和GAD3的突变使番茄的糖分(Brix)和GABA含量增加,并在高温条件下诱导出单性结实现象。单性结实的发生与HWS基因无法正常调节转录组有关,导致植物激素相关果实发育过程发生更动态的变化。这些发现表明,基因改造可以提升番茄的品质和适应气候变化的能力。
引言
番茄是全球重要的农作物,年产量约为1.89亿吨(FAO,2023年)。研究表明,番茄含有多种功能性成分,如维生素、番茄红素和γ-氨基丁酸(GABA)(Kaboré等人,2022年)。研究人员利用新型工具尝试培育高营养价值的番茄品种(Kawaguchi,2024年)。例如,通过基因编辑技术培育出的高GABA含量的番茄已实现商业化(Nagamine和Ezura,2022年)。GABA是一种抑制性神经递质,在哺乳动物中枢神经系统中具有降低血压和缓解焦虑的作用(Boonstra等人,2015年)。SlGAD3基因编码谷氨酸脱羧酶3,该酶在果实中GABA的积累过程中起关键作用,通过去除谷氨酸的羧基来促进GABA的合成。SlGAD3的C末端含有自抑制结构域,在正常情况下可保持酶的非活性状态。当细胞内钙离子水平因胁迫而升高时,钙钙调蛋白复合物会与自抑制结构域中的结合位点结合,从而激活酶的活性(Takayama和Ezura,2015年;Nonaka,2017年)。
虽然培育高品质番茄品种至关重要,但确保稳定的产量同样重要。近期研究表明,气候变化(尤其是全球变暖)会导致番茄产量波动(Bhandari等人,2021年;Suman等人,2022年;Onyeneke等人,2023年)。全球变暖加剧了病虫害的发生,使得作物种植面临挑战。此外,高温环境会改变植物的生理机能,例如生殖器官对温度变化非常敏感(Zinn等人,2010年)。番茄的最佳结实温度范围为21至24°C(Geisenberg和Stewart,1996年)。当白天温度超过32°C、夜间温度仍高于21°C时,果实形成和总产量会显著下降(Moore和Thomas,1952年;Ahmadi和Stevens,1979a;Ahmadi和Stevens,1979b)。为解决这一问题,人们采取了多种措施来稳定番茄产量。其中,诱导单性结实现象是一个有前景的突破。单性结实是指无需受精即可形成果实的现象,可通过生长激素(如生长素、赤霉素和细胞分裂素)实现。已鉴定出与这些激素相关的多个基因,如IAA9和Pad1,其突变体表现出单性结实特性(Matsuo等人,2020年;Mubarok等人,2023年)。此外,SlHWS突变体(HAWAIIAN SKIRT)在Micro-Tom品种中表现出单性结实现象(Damayanti等人,2019年)。HWS拟南芥中被发现,它编码一种参与miRNA生物合成的F-box蛋白(Zhang等人,2017年;Lang等人,2018年)。受该F-box蛋白调控的miRNA中,miRNA159可调节GAMYB(赤霉素myb)基因的表达。过表达该miRNA的番茄品系在Micro-Tom品种中表现出单性结实(da Silva等人,2017年)。除了单性结实特性外,slhws突变体由于韧皮部面积扩大而表现出更高的糖分积累(Lombardo等人,2021年)。
最新研究表明,hws突变体中某些miRNA的表达水平高于野生型(WT)植物(Damayanti等人,2019年;Lombardo等人,2025年)。HWS蛋白含有F-box结构域,可与Skp-Cullin-F-box复合体(SCF)相互作用,该复合体是一种多蛋白E3泛素连接酶,负责将目标蛋白标记为26S蛋白酶体降解。已鉴定出HWS中F-box结构域的多个靶标,如HASTY(HST)和MEDIATOR 37(MED37),它们通过调控miRNA的细胞间运输来影响其非自主功能;AGO1则通过将miRNA从细胞核转运到细胞质中发挥自主调控作用。此外,HWS蛋白还含有Kelch重复序列,可与核孔复合体(NPC)中的蛋白质相互作用,从而参与miRNA的核输出(Gonzalo等人,2025年)。
本研究通过基因编辑针对HWS和GAD3的自抑制结构域,旨在培育出单性结实能力更强的高品质番茄。
章节摘录
植物与生长条件
本研究使用的番茄(Solanum lycopersicum)由Sanatech Life Science Co., Ltd.提供。培养室的温度维持在25°C,光照周期为16小时光照和8小时黑暗。种子在培养室中发芽后生长6周,随后将6周大的植株移栽到温室中。温室内的种植和收获工作在春季进行(3月1日至4月30日)。
为了利用CRISPR/Cas9技术生成含有T-DNA的番茄,通过胚叶组织培养获得了129株再生植株。其中31株经过MultiNA初步筛选后被选中进行测序,确认了7株目标位点的突变(补充表4)。部分植株还检测到多重突变。
在T1代中,这些突变从四个hwsgad3品系中遗传而来。
本研究通过单次基因编辑成功引入了hws和gad3突变,并研究了突变体的特性。结果显示,商业品种背景下的hws突变体部分性状与Micro-Tom品种一致,但与其他突变体存在差异。
在Micro-Tom的hws突变体中,植株的营养生长增强而开花延迟,而HG品系的差异较为轻微。
(Lobardo等人,2025年;Ning等人,2021年)
三浦健二(Kenji Miura):撰写 – 审稿与编辑、项目管理、资金筹集、概念构思。岩间武(Takeru Iwama):数据分析。崔承哲(Seungje Choi):撰写 – 初稿撰写、数据分析。江村宏(Hiroshi Ezura):资金筹集、概念构思。小林美咲(Misaki Kobayashi):撰写 – 审稿与编辑、数据分析。
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