水平基因转移在多种真核生物中普遍存在

《BMC Genomics》：Horizontal gene transfer is widespread in diverse eukaryotes

　　

摘要

水平基因转移（HGT）是指在亲缘关系较远的生物体之间传递遗传物质的过程。尽管HGT是原核生物中普遍存在的基因交换机制，但涉及真核生物的基因转移事件通常被认为较为罕见，并且仅限于少数谱系。在本研究中，我们对包括人类、小鼠、牛、蜥蜴、青蛙、斑马鱼、果蝇、线虫、拟南芥和酵母在内的10种真核生物的基因组进行了全基因组范围的HGT区域识别。通过将这些真核生物的基因组与数千种真核生物、细菌和病毒的基因组进行比较，我们发现每种真核生物物种中存在10到237个非重复的HGT事件。我们对所分析的10个基因组中的大多数进行了第三代测序，并结合拟南芥中的靶向PCR技术，以验证HGT结果并排除污染。受到HGT影响的基因主要集中在跨膜转运功能上。某些HGT事件在宿主基因组中发生了广泛的复制，影响了数百甚至数千个基因。我们的研究结果表明，HGT在所有分析的真核生物中普遍存在，并且它是真核生物基因组进化中一个不可忽视、但此前被低估的贡献因素。