单细胞全基因组测序揭示了伯基特淋巴瘤中的趋同进化现象

《Nature Communications》：Single-cell whole-genome sequencing reveals convergent evolution in Burkitt lymphoma

　　

摘要

伯基特淋巴瘤具有多种致癌驱动因素，但其主要发生在儿童身上，而儿童的正常细胞中很少存在与年龄相关的突变。为了解释这一矛盾，我们试图确定伯基特淋巴瘤发展过程中突变驱动因素的序列及其发生时间。我们分析了250对来自伯基特淋巴瘤患者的正常B细胞和恶性B细胞的单细胞全基因组测序数据，并将这些数据与21个批量全基因组测序样本以及一个包含157个来自健康个体的克隆扩增B细胞的现有数据集进行了整合。系统发育重建显示，在最近共同祖先出现后，突变开始加速积累，从而导致肿瘤内部出现广泛的遗传异质性。此外，我们还提供了证据表明，在点突变和拷贝数变异两个层面上，趋同进化也参与了这种多样性的形成。这一深入的表征进一步确立了伯基特淋巴瘤作为肿瘤发生模型的典型代表，对其治疗干预具有重要的启示意义。