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一项多组学研究揭示了儿科结核病在通路层面的机制,并发现了具有预测价值的生物标志物
《Clinical Proteomics》:A multi-omics study reveals pathway-level insights and predictive biomarkers in pediatric TB
【字体: 大 中 小 】 时间:2026年06月10日 来源:Clinical Proteomics 3.3
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摘要背景结核病(TB)仍然是一个全球性的健康威胁,每年有超过一百万15岁以下的儿童受到影响。由于诊断方面的挑战,许多患有结核病的儿童未能得到治疗。方法我们通过对四个高负担国家的疑似结核病儿童的血浆蛋白质组学和代谢组学数据进行了整合,对儿童结核病进行了多组学分析。使用multiGS
结核病(TB)仍然是一个全球性的健康威胁,每年有超过一百万15岁以下的儿童受到影响。由于诊断方面的挑战,许多患有结核病的儿童未能得到治疗。
我们通过对四个高负担国家的疑似结核病儿童的血浆蛋白质组学和代谢组学数据进行了整合,对儿童结核病进行了多组学分析。使用multiGSEA进行了通路富集分析,以识别相关的免疫和代谢通路。我们还应用了mixOmics和多视图方法来发现诊断生物标志物,并比较了多组学特征与来自单组学数据集的特征的性能。
富集分析揭示了几条免疫和代谢通路,包括PTEN和RUNX2调控通路,以及精氨酸和脯氨酸代谢通路,这些通路是通过数据整合唯一识别出来的。虽然多组学模型相比单组学模型有轻微的改进,但蛋白质组学单独使用时通常表现更好,并且在准确区分儿童确诊结核病和疑似结核病方面显示出更大的潜力。
这些发现表明,结合互补的分子层面可以更深入地理解疾病机制,并突显了蛋白质组学在改善儿童结核病诊断方面的潜力。
结核病(TB)仍然是一个全球性的健康威胁,每年有超过一百万15岁以下的儿童受到影响。由于诊断方面的挑战,许多患有结核病的儿童未能得到治疗。
我们通过对四个高负担国家的疑似结核病儿童的血浆蛋白质组学和代谢组学数据进行了整合,对儿童结核病进行了多组学分析。使用multiGSEA进行了通路富集分析,以识别相关的免疫和代谢通路。我们还应用了mixOmics和多视图方法来发现诊断生物标志物,并比较了多组学特征与来自单组学数据集的特征的性能。
富集分析揭示了几条免疫和代谢通路,包括PTEN和RUNX2调控通路,以及精氨酸和脯氨酸代谢通路,这些通路是通过数据整合唯一识别出来的。虽然多组学模型相比单组学模型有轻微的改进,但蛋白质组学单独使用时通常表现更好,并且在准确区分儿童确诊结核病和疑似结核病方面显示出更大的潜力。
这些发现表明,结合互补的分子层面可以更深入地理解疾病机制,并突显了蛋白质组学在改善儿童结核病诊断方面的潜力。