首次发现与急性呼吸道感染暴发相关的人类腺病毒7型缺失突变体

《Virology Journal》：First detection of human adenovirus type 7 deletion mutant associated with an outbreak of acute respiratory infection

　　

摘要

背景

近年来，人类腺病毒B7（HAdV-B7）已成为一种日益重要的呼吸道病原体。2024年11月13日至21日期间，北京一所小学的10名一年级学生出现了急性呼吸道感染的症状。我们对此次疫情的病因进行了调查。

方法

在当地疾病预防和控制中心的合作下，我们收集了受影响学生的 demographic 信息（年龄和性别），并从6名学生身上获取了咽拭子样本。我们使用多重实时PCR技术对这些样本中的22种常见呼吸道病毒进行了检测。为了分离HAdV，我们将HAdV阳性的咽拭子样本接种到Hep-2细胞中。分离出的病毒株通过Sanger测序和全基因组测序进行了分析。此外，我们还对2024年至2025年流感样疾病监测病例中分离出的4株HAdV-B7菌株进行了测序，以确定是否存在相同的突变。通过基因同源性分析、重组分析和系统发育重建对这些菌株进行了分子特征鉴定。

结果

经学生同意，我们收集了10名学生的6份咽拭子样本。所有样本通过多重实时PCR检测均为HAdV阳性。这些学生均未同时感染其他病毒。我们成功从每个学生的样本中分离出了HAdV菌株。对六邻体（hexon）、五邻体（penton）和纤维蛋白（fiber）基因的Blast分析和系统发育分析表明，此次疫情是由HAdV-B7（P7H7F7）引起的。在这次疫情中，我们在五邻体碱基的RGD环中发现了一个独特的T335S突变。全基因组测序证实，我们的分离株与中国及国外多个地区的HAdV-B7菌株具有高度序列一致性。此外，此次疫情中分离出的所有菌株在E3区域都存在57个核苷酸的缺失。有趣的是，在2024年至2025年流感样疾病监测病例中分离出的HAdV-B7菌株中也发现了相同的缺失突变，这表明这种缺失突变较为普遍，可能代表了一种流行的HAdV-B7亚系的分子特征。

结论

我们首次报告了与2024年北京急性呼吸道感染疫情相关的人类腺病毒7型缺失突变体的发现。这种缺失突变较为普遍，可能代表了一种流行的HAdV-B7亚系的分子特征。这种突变如何影响病毒的致病性尚不清楚，需要进一步研究。我们的发现强调了及时实施分子监测在指导疫情控制和制定针对呼吸道病原体的预防策略方面的重要性。

背景

近年来，人类腺病毒B7（HAdV-B7）已成为一种日益重要的呼吸道病原体。2024年11月13日至21日期间，北京一所小学的10名一年级学生出现了急性呼吸道感染的症状。我们对此次疫情的病因进行了调查。

方法

在当地疾病预防和控制中心的合作下，我们收集了受影响学生的 demographic 信息（年龄和性别），并从6名学生身上获取了咽拭子样本。我们使用多重实时PCR技术对这些样本中的22种常见呼吸道病毒进行了检测。为了分离HAdV，我们将HAdV阳性的咽拭子样本接种到Hep-2细胞中。分离出的病毒株通过Sanger测序和全基因组测序进行了分析。此外，我们还对2024年至2025年流感样疾病监测病例中分离出的4株HAdV-B7菌株进行了测序，以确定是否存在相同的突变。通过基因同源性分析、重组分析和系统发育重建对这些菌株进行了分子特征鉴定。

结果

经学生同意，我们收集了10名学生的6份咽拭子样本。所有样本通过多重实时PCR检测均为HAdV阳性。这些学生均未同时感染其他病毒。我们成功从每个学生的样本中分离出了HAdV菌株。对六邻体、五邻体和纤维蛋白基因的Blast分析和系统发育分析表明，此次疫情是由HAdV-B7（P7H7F7）引起的。在这次疫情中，我们在五邻体碱基的RGD环中发现了一个独特的T335S突变。全基因组测序证实，我们的分离株与中国及国外多个地区的HAdV-B7菌株具有高度序列一致性。此外，此次疫情中分离出的所有菌株在E3区域都存在57个核苷酸的缺失。有趣的是，在2024年至2025年流感样疾病监测病例中分离出的HAdV-B7菌株中也发现了相同的缺失突变，这表明这种缺失突变较为普遍，可能代表了一种流行的HAdV-B7亚系的分子特征。

结论

我们首次报告了与2024年北京急性呼吸道感染疫情相关的人类腺病毒7型缺失突变体的发现。这种缺失突变较为普遍，可能代表了一种流行的HAdV-B7亚系的分子特征。这种突变如何影响病毒的致病性尚不清楚，需要进一步研究。我们的发现强调了及时实施分子监测在指导疫情控制和制定针对呼吸道病原体的预防策略方面的重要性。