基于亚洲筛查阵列的植入前遗传检测工作流程在多种遗传疾病临床应用中的研究

《Orphanet Journal of Rare Diseases》：Clinical application of an Asian Screening Array-based preimplantation genetic testing workflow for various genetic disorders

　　

摘要

背景

针对单基因疾病的植入前遗传检测（PGT-M）是一种关键的临床策略，旨在防止遗传疾病从携带者传给后代，其诊断效果在很大程度上取决于检测平台的准确性和覆盖范围。像亚洲筛查阵列（Asian Screening Array，ASA）这样的全基因组SNP阵列在PGT-M的单倍型分析中表现出了良好的性能。在这里，我们系统地评估了基于亚洲筛查阵列的PGT工作流程在不同遗传疾病检测中的效率。

方法

我们通过回顾377个接受PGT-M临床前检测的家族谱系和367个基于亚洲筛查阵列的PGT-M临床周期（共1677个胚胎）进行了回顾性分析。我们建立了结合ASA单倍型分析和基于不同遗传模式的个性化直接突变检测的检测策略。对于具有新生致病变异或缺乏家庭成员样本的家庭，采用了长读长测序或单精子单倍型分析方法。对于不同的病例，还采用了Gap-PCR、RP-PCR、PCR-RFLP等个性化直接突变检测方法。

结果

结果表明，我们基于ASA的PGT工作流程在临床上是有效的，该流程整合了连锁分析、直接突变检测和染色体CNV筛查。在大多数病例中，目标基因/区域上游和下游区域可用于连锁分析的SNP数量是充足的。针对不同病例的个性化直接突变检测方法也验证了ASA单倍型分析的结果。在单倍型分析中，基于长读长测序的方法比单精子单倍型分析方法更有效。针对具有微缺失和串联重复的家庭，我们建立了详细的单倍型分析策略。经过连锁分析和CNV检测后，共有636个胚胎被认为适合移植。

结论

本研究验证了基于ASA的方法在PGT中的可行性和优越性，并为不同遗传疾病的临床预防提供了标准化和可靠的技术解决方案。