基于NIPT的产前筛查方法，用于检测80,371例妊娠中的母亲Xq28拷贝数变异情况

《Archives of Gynecology and Obstetrics》：NIPT-based prenatal screening of maternal Xq28 copy number variations in a cohort of 80,371 pregnancies

　　

摘要

目的

拷贝数变异（CNVs）可能导致多种基因组疾病和不同的临床表型。本研究旨在评估无创产前检测（NIPT）在筛查涉及Xq28重复区域的母体拷贝数变异（CNVs）方面的可行性和可靠性。

方法

在这项回顾性、单中心研究中，我们分析了2017年至2022年间80,371名孕妇的NIPT数据，以检测母体的CNVs。重点关注通过NIPT检测到的涉及int22h1/int22h2介导的Xq28重复区域的母体CNVs。如果剩余的母体淋巴细胞可用，随后进行染色体微阵列分析（CMA）来验证NIPT的结果。

结果

通过NIPT共检测到48例（0.060%，95% CI 0.045%?~?0.079%）涉及int22h1/int22h2介导的Xq28重复区域的母体CNVs，其中包括29例（0.036%，95% CI 0.025%?~?0.052%）的致病性缺失，缺失范围为128.1 kb至93,244.3 kb；17例（0.021%，95% CI 0.013%?~?0.034%）的致病性重复，重复范围为442.5 kb至2059.1 kb；以及2例（0.002%，95% CI 0.000%?~?0.009%）意义不明确的变异（VOUS），变异范围为215.2 kb至326.1 kb。典型的Xq28重复微缺失和微重复的检测率分别为0.005%（4/80,371，95% CI 0.002%?~?0.013%）和0.006%（5/80,371，95% CI 0.003%?~?0.015%）。在22例剩余母体淋巴细胞可用的情况下，进行了染色体微阵列分析（CMA）来验证NIPT的结果。在这22例中，NIPT检测母体CNVs的阳性预测值（PPV）为100.0%（95% CI 85.1%?~?100.0%）。

结论

本研究展示了NIPT检测涉及Xq28重复区域的母体CNVs的可行性和潜力。