一项针对中国细胞系鉴定的十年回顾性分析，使用了超过10,000个样本

《Communications Biology》：A decade-long retrospective analysis of cell line authentication in China using over 10,000 samples

　　

摘要

自1951年HeLa细胞系建立以来，永生化细胞系已成为基础和临床生物医学研究中不可或缺的体外模型。然而，错误鉴定和污染问题仍然影响着实验的可重复性和有效性。在2016年至2025年间，我们使用STR（短串联重复序列）分析技术对来自6,947家中国机构的11,087个细胞系进行了鉴定。十年来的数据分析显示，检测量和准确性逐年稳步提升，其中HeLa、T24、K-562、HEK293T和A-549是最常见的污染源。我们发现这些核心STR位点的突变率比生殖系突变的突变率高两个到三个数量级。鉴于这些位点在基因组稳定性上的明显差异，我们开发了一种基于八个核心位点特异性突变频率的加权算法。重新分析表明，该算法在减少假阳性和假阴性的同时提高了整体的检测严格性，优于传统的Tanabe方法。此外，随着小鼠模型使用的增加，迫切需要更全面的参考数据库。我们的大规模分析反映了中国生物医学界在解决细胞系错误鉴定问题上的日益重视，为防止污染提供了重要见解，并为下一代细胞系鉴定策略提供了理论依据。