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来自NEREA天文台的真核生物宏基因组(MAGs):扩展沿海微生物组数据集

《Scientific Data》:Eukaryotic MAGs from the NEREA observatory: expanding the coastal microbiome dataset

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年06月10日 来源:Scientific Data 6.9

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  摘要海洋生态系统是生物多样性和生物地球化学活动的热点区域,然而,由于缺乏基因组级别的数据,其许多复杂性仍然难以被揭示。在这里,我们提供了一个精心整理的数据集,其中包含52个真核生物宏基因组(MAGs),这些宏基因组是从2019年4月至2020年1月期间在纳波利湾的三个NEREA(

  

摘要

海洋生态系统是生物多样性和生物地球化学活动的热点区域,然而,由于缺乏基因组级别的数据,其许多复杂性仍然难以被揭示。在这里,我们提供了一个精心整理的数据集,其中包含52个真核生物宏基因组(MAGs),这些宏基因组是从2019年4月至2020年1月期间在纳波利湾的三个NEREA(纳波利生态研究增强观测站)站点收集的样本中重建而来的。NEREA是一个沿海观测站,它将物理、化学和生物测量数据与先进的宏基因组学技术相结合。这些真核生物宏基因组的平均完整性约为55%,基因组大小约为20 Mb。预测的蛋白质通过UniProtKB、InterPro和eggNOG数据库进行了功能注释,并且每个宏基因组都使用了一个经过整理的RNA聚合酶A参考数据集进行了分类。这些重建的宏基因组涵盖了多种真核生物谱系,主要包括褐藻门(Ochrophyta)、绿藻门(Chlorophyta)和甲藻门(Haptophyta)。基于Tara Oceans项目在真核生物宏基因组方面的研究成果,这一数据集代表了首次从沿海时间序列中重建真核生物宏基因组,从而实现了对真核浮游生物的时间和功能分析。

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