通过m6A-衰老多组学技术在喉鳞状细胞癌中鉴定出HMGA2

《Scientific Reports》：HMGA2 identified via m6A-senescence multi-omics in laryngeal squamous cell carcinoma

　　

摘要

N6-甲基腺苷（m6A）修饰和细胞衰老分别与肿瘤生物学相关，但喉鳞状细胞癌（LSCC）中与m6A相关的衰老基因的研究仍较为有限。在这项研究中，我们结合了批量转录组学、单细胞转录组学、体细胞突变和拷贝数变异数据以及蛋白质组学，进行了综合多组学分析，以探讨m6A相关衰老的临床和分子效应。我们发现了93个具有预后价值的潜在m6A相关衰老基因，并定义了具有不同免疫特征、生存结局和通路活性的分子亚型。通过差异表达基因进一步分层分析，发现了更多的异质性；此外，我们构建的m6A相关衰老评分（m6ASenScore）与预后和突变负担之间存在显著关联。单细胞分析揭示了具有亚型特异性代谢和炎症特征的恶性上皮亚群。在五个核心候选基因中，HMGA2在蛋白质水平上显著上调。在LSCC细胞系中的功能实验表明，降低HMGA2水平可以抑制细胞生长、侵袭和迁移。本研究全面描述了m6A相关衰老的特征，并指出HMGA2可能是LSCC的治疗靶点。