胆管癌与胆囊癌的基因组特征与临床结局的比较分析

《Scientific Reports》：Comparative analysis of genomic profiles and clinical outcomes in cholangiocarcinoma and gallbladder cancer

　　

摘要

胆管癌（CCA）和胆囊癌（GBC）表现出不同的生物学特性和治疗反应，这可能是由于它们的基因组特征存在差异所致。然而，针对胆道癌（BTC）的基因组研究仍然较为有限。本研究对258名BTC患者的下一代测序数据进行了回顾性分析（其中188例为CCA，70例为GBC），并纳入了纪念斯隆-凯特琳癌症中心（MSKCC）的外部队列作为对照。在BTC患者中，最常见的基因突变包括TP53（56.6%）、KRAS（27.9%）、CDKN2A（21.3%）、TERT（17.8%）和MCL1（14.3%）。CCA的主要特征是ARID1A（15.4% vs 5.7%，P = 0.04）和PBRM1（10.1% vs 0%，P = 0.003）的突变，以及MCL1的扩增（17.0% vs 5.7%，P = 0.03）；而GBC则表现出更高的TP53突变频率（78.6% vs 47.9%，P < 0.001）、ARID2（15.7% vs 3.7%，P = 0.002）、TERT（24.3% vs 11.2%，P = 0.02）、CCNE1的扩增（21.4% vs 2.7%，P < 0.001）以及SOX2的扩增（4.3% vs 0%，P = 0.02）。GBC还显示出DNA损伤修复（DDR）通路（84.3% vs 71.3%，P = 0.04）和p53信号通路（88.6% vs 59.6%，P < 0.001）的显著改变。此外，39.9%的BTC患者至少存在一个可治疗的基因组突变。在258名患者中，有7.0%（18例）携带种系变异，其中大部分发生在DDR（61.1%）和p53（22.2%）通路中。与MSKCC队列的比较显示，两组的基因组特征和突变相似。CCA患者的总体生存期（OS）显著长于GBC患者（中位OS分别为41.2个月和24.3个月，P = 0.003）。在MSKCC队列中，高肿瘤突变负荷（TMB-H_med）与较差的生存期相关（HR = 1.43，P = 0.01），而PBRM1突变与较好的生存期相关（HR = 0.50，P = 0.02）。本研究强调了GBC和CCA之间不同的基因组特征，为这些侵袭性癌症的分子机制提供了宝贵的见解，并有助于精准医疗策略的发展。