从小分子晶体结构中确定键长半径

《Journal of Cheminformatics》：Determination of bonding radii from small-molecule crystal structures

　　

摘要

X射线晶体学很少能够直接显示所研究结构中原子之间的化学键合情况。通常情况下，人们会使用基于距离的启发式方法来确定成键原子对。这类方法中的一类依赖于一组键合半径，这些半径用于估算化学元素在键中的理想化尺寸。本文介绍了一种无监督的工作流程，该方法可以从晶体学开放数据库（Crystallography Open Database）中的晶体结构数据中推导出键合半径集合。