化学共生物种Rugalucina vietnamica（Lucinida: Lucinidae）的染色体级基因组组装

《Scientific Data》：A chromosome-level genome assembly of the chemosymbiotic species Rugalucina vietnamica (Lucinida: Lucinidae)

　　

摘要

Rugalucina vietnamica是海洋化能合成生态系统中的代表性共生双壳类动物之一。该物种主要分布于西太平洋的北部湾-琼州海峡沿岸地区，使其成为研究南海沿海底栖动物演化和扩散的理想模型。然而，由于缺乏高质量的参考基因组，全基因组范围内的遗传变异分析受到限制，群体基因组学研究也难以开展。在本研究中，我们通过整合PacBio、Illumina技术和高分辨率染色体构象捕获测序技术，成功构建了R. vietnamica的高质量染色体级基因组。最终组装的基因组大小为1.23 Gb，N50值为78 Mb，并成功锚定在17条染色体上。BUSCO分析显示，该基因组包含了96.50%的保守后生动物基因，说明其完整性较高。基因组注释进一步表明，转座元件占基因组的65.56%，共预测出18,649个蛋白质编码基因。