FGD3作为预后和免疫生物学标志物：对其在肿瘤进展及免疫系统中的作用进行的泛癌症分析

《Cancer Cell International》：FGD3 as a prognostic and immunological biomarker: a pan-cancer analysis of its role in tumor progression and the immune landscape

　　

摘要

背景

FGD3 是 FGD 家族的一员，它调节 GTPase 的活性和细胞形态，从而影响肿瘤的增殖和迁移。然而，其在不同类型癌症中的作用尚未得到充分了解。

方法

利用 TCGA 和 GTEx 数据库，比较了肿瘤组织和正常组织中的 FGD3 表达情况，以评估其与癌症的相关性。来自 TISCH 的单细胞转录组数据用于分析免疫细胞亚群中的 FGD3 表达。通过单变量 Cox 回归分析评估了 FGD3 表达与患者生存期之间的关联。TIMER2.0 斯皮尔曼相关性分析研究了其与免疫细胞浸润的关系。基因集富集分析（GSEA）和基因集变异分析（GSVA）揭示了 FGD3 与免疫和代谢途径的关联。生物信息学和分子对接预测了其与抗癌药物的相互作用。实验验证表明，FGD3 的敲低可以抑制癌细胞的迁移和增殖，表明其在乳腺癌中具有抗肿瘤作用。

结果

FGD3 在不同肿瘤中的表达存在差异，其预后意义也各不相同。在大多数恶性肿瘤中，FGD3 的表达与拷贝数变异（CNV）和甲基化呈负相关，并与免疫治疗生物标志物和反应相关。ESTIMATE 和免疫浸润分析表明 FGD3 可能参与免疫抑制和肿瘤免疫过程。实验性下调 FGD3 显著减少了细胞的增殖和迁移，突显了其治疗潜力。

结论

FGD3 在肿瘤发生和进展中起着重要作用，可能成为癌症预后的有希望的生物标志物。其表达与肿瘤转移呈负相关。实验结果进一步表明，FGD3 可能在乳腺癌中起到抑制细胞迁移的作用。总体而言，这些结果为 FGD3 的生物学作用提供了新的见解，并提示其作为治疗靶点的潜力。