非小细胞肺癌中调控网络的编辑：对免疫和转移的影响

《Human Genomics》：Editing regulatory network in non-small cell lung cancer: implications for immunity and metastasis

　　

摘要

背景

RNA编辑在癌症发展中起着关键作用，多个编辑事件共同作用产生的影响大于单个事件的影响。然而，RNA编辑的协同效应仍不甚明了。

方法

我们提出了一个综合框架，用于研究RNA编辑事件之间的相互作用，既涵盖了全局编辑情况，也分析了特定位点的功能效应。进一步探讨了这些RNA编辑模块，以揭示从RNA编辑角度出发的基因相互作用和调控机制。

结果

以非小细胞肺癌为例，我们发现了12个以上参与免疫调节和转移相关过程的模块，证明了它们的临床相关性。从机制上看，RNA编辑影响了miRNA对EIF2AK2和PRKAR2A的调控，以及AHR的转录因子活性，还影响了DDX3X的RNA结合调控，从而凸显了其在塑造基因调控网络中的作用。

结论

总体而言，本研究提供了一个系统化的、基于模块的框架，用于理解RNA编辑的协同作用，为RNA编辑介导的基因相互作用提供了新的见解，并揭示了一种研究疾病分子机制的补充方法。