完成对内在无序蛋白质中最常见的275种二肽的核磁共振（NMR）谱图解析任务

《Scientific Data》：Complete NMR assignment for 275 of the most common dipeptides in intrinsically disordered proteins

　　

摘要

准确的核磁共振（NMR）化学位移鉴定对于蛋白质的原子级结构表征至关重要。然而，对于内在无序蛋白质（IDPs）及其特定区域（IDRs），由于光谱重叠和构象异质性，这一任务仍然非常耗时且具有挑战性。因此，完整的侧链鉴定结果较为罕见。在这里，我们提供了一个全面的参考数据集，其中包含了IDPome中275种最常见二肽的完整NMR化学位移信息，覆盖了该数据库中93%的二肽。此外，我们还报告了含有天冬氨酸或谷氨酸的二肽的侧链质子化依赖性化学位移。该数据集包含了所有可通过NMR技术检测到的主链和侧链核素的信息，共计11,571个经过验证的数据点，以及用于化学位移鉴定的1D（¹H, ¹³C）和2D（¹H–¹⁵N HSQC、¹H–¹³C HSQC、TOCSY、NOESY、¹H–¹³C HMBC）光谱，使其成为训练、测试和评估数据驱动蛋白质鉴定、峰值挑选及合成光谱生成工具的丰富资源。为了便于机器学习应用，所有数据均以标准化、机器可读的格式提供。