TRNAU1AP和PRPF39共同调控了人类中最丰富的非编码RNA的加工过程

《Nature Communications》：TRNAU1AP and PRPF39 establish integrated control over processing of most abundant human non-coding RNAs

　　

摘要

尽管与转移相关的长非编码RNA MALAT1的丰度取决于其含有三螺旋结构的3′端的非经典加工过程，但这一步骤的调控机制至今仍不清楚。通过迭代的全基因组筛选，我们发现了TRNAU1AP和PRPF39这两种因子，它们共同调控MALAT1的3′端加工，从而降低了其表达水平。进一步研究表明，这些因子属于一个先前未被发现的RNase MRP和RNase P调控通路（RMPPc）。该通路不仅调控MALAT1的加工，还参与MEN-β、前体rRNA中的内部转录间隔序列以及前体tRNA中的5′引导序列的加工，进而影响翻译所需的基本过程。我们发现这种广泛的调控作用是通过一个关键调控点实现的：即RPP14中包含起始ATG序列的外显子2的插入。RPP14是RNase MRP和RNase P的重要组成部分，因此它同时调控这两种催化RNA——MRP RNA和H1 RNA的生成。最后，我们发现在这个主要调控点上游，RMPPc通路形成了一个高度相互关联的反馈回路，该回路稳定了人类细胞中超过90%的RNA分子的转录后加工过程。