IDMME与IDMDE：用于时空特异性RNA m5C编辑的可诱导CRISPR-dCasRx平台

《Genome Biology》：IDMME and IDMDE: inducible CRISPR-dCasRx platforms for spatiotemporal RNA m5C editing

　　

摘要

RNA 5-甲基胞嘧啶（m⁵C）是一种与肿瘤发生相关的动态表观遗传标记，然而现有的编辑工具缺乏时空调控能力以及可逆性。在此，我们开发了由脱落酸（ABA）诱导的CRISPR-dCasRx系统，用于实现可编程的m⁵C甲基化（IDMME）和去甲基化（IDMDE）操作。这些编辑工具通过配体依赖性的分裂效应域组装方式，实现特异性且低脱靶率的m⁵C修饰。此外，我们还整合了光控型ABA，从而实现光照驱动的激活功能。在肾癌模型中的应用表明，靶向m⁵C编辑能够调节转录本功能，并在体外和体内抑制肿瘤生长。这一平台为解析RNA表观遗传机制以及推进基于RNA的治疗策略提供了一种多功能、可时空控制的解决方案。