2019–2020年马来西亚再次出现的基孔肯雅病毒疫情调查

《BMC Infectious Diseases》：Outbreak investigation of reemerging chikungunya virus in Malaysia in 2019–2020

　　

摘要

背景

基孔肯雅病毒是一种通过蚊子传播的病原体，给热带地区带来了沉重的公共卫生负担。在经历了数十年的零星传播后，马来西亚在2019年出现了基孔肯雅病毒病例的惊人反弹。本研究探讨了在长期零星传播之后，该病毒在马来西亚再次出现的状况。

方法

2019年10月至2020年2月期间，研究人员在马来西亚霹雳州的三个疫情高发地区（坎蓬巴鲁艾尔库宁、比多尔和松凯）分两个阶段进行了疫情调查。共从78名受检者身上采集了血液样本，并通过实时逆转录聚合酶链反应和酶联免疫吸附试验对其进行了检测。随后分离出基孔肯雅病毒并对其进行全基因组测序，所得序列再通过系统发育分析、比较序列分析以及选择压力分析等方法进行解读。

结果

本研究显示，基孔肯雅病毒的阳性率为69.2%（54/78），同时有9.3%（5/54）的病例存在登革病毒合并感染的情况。系统发育分析表明，本研究中的基孔肯雅病毒属于东/中/南非-印度洋谱系，且与2015年至2019年间泰国、中国、缅甸、孟加拉国、意大利、巴基斯坦和印度的最新疫情病毒株属于同一类群，而非2009年马来西亚疫情中的病毒株。2019年马来西亚的病毒株与2018年泰国的病毒株核苷酸相似度较高，为99.78%至99.89%。在马来西亚重新出现的基孔肯雅病毒中存在E1-226 A、E1-K211E和E2-V264A等突变，这些突变有助于提高该病毒在埃及伊蚊体内的存活能力，同时还存在与病毒毒性增强相关的nsP3-R524Opal突变。这些突变与2015年至2019年间全球流行的病毒株一致，反映出病毒对传播媒介的适应性以及疾病的严重程度。

结论

在马来西亚重新出现的ECSA-IOL谱系病毒在基因上与2009年的马来西亚疫情病毒株有所不同，但与2015年至2019年间全球流行的病毒株高度相似。综合来看，它很可能是通过跨境传播从邻国泰国传入的。