通过共价片段筛选确定难处理蛋白质靶标中具有功能意义的可操作赖氨酸位点

《ChemBioChem》:Mapping Functionally Relevant Tractable Lysines of Challenging Protein Targets by Covalent Fragment Screening

【字体: 时间:2026年06月13日 来源:ChemBioChem 2.8

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   摘要 共价片段筛选已成为识别可用于攻击难以处理的蛋白质靶点的氨基酸残基或合适化学起始材料的有效策略。近年来,赖氨酸作为一种适合用于共价标记的亲核残基,越来越受到关注。在此,我们展示了一个包含多种 warhead 的针对赖氨酸的

  

摘要

共价片段筛选已成为识别可用于攻击难以处理的蛋白质靶点的氨基酸残基或合适化学起始材料的有效策略。近年来,赖氨酸作为一种适合用于共价标记的亲核残基,越来越受到关注。在此,我们展示了一个包含多种 warhead 的针对赖氨酸的共价片段文库。该文库中各组分的反应性和稳定性已经过系统研究,随后这些组分被用于检测一系列具有治疗意义且难以处理的蛋白质靶点。我们找到了适用于这些靶点的 warhead,并通过酶解和建模方法分析了其结合位点。这些发现表明,基于赖氨酸的共价化学方法在药物化学和化学生物学领域中,有助于发现新的结合位点,并优化针对不同蛋白质靶点的 warhead。

图表摘要

通过将针对赖氨酸的共价片段文库用于检测难以处理的蛋白质靶点,我们找到了合适的 warhead,并明确了结合位点,为开发靶向共价配体奠定了基础。

利益冲突声明

作者声明不存在利益冲突。

数据可用性说明

本研究的相关数据可在本文的补充信息中找到。

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