揭示健康葡萄藤与埃斯卡病葡萄藤的菌群组成：不同微生境、季节、年份及品种间的真菌群落动态

《Environmental Microbiome》：Unveiling the mycobiome of healthy and Esca diseased grapevines: fungal community dynamics across different microhabitats, seasons, years, and cultivars

　　

摘要

背景

葡萄藤上栖息着多种微生物群落，其中包括与葡萄藤干病相关的真菌病原体，这类疾病对葡萄栽培构成了重大威胁。尽管已有大量研究，但不同葡萄藤微生境中真菌群落组成的生态驱动因素仍不明确。我们利用ITS2代谢条形码技术，分析了患埃斯卡病和未患病的葡萄藤的树皮、木质部及土壤中的真菌群落，并研究了季节、年份、品种、微生境以及植株健康状况对关键功能群的影响。

结果

季节变化对真菌多样性影响较小，而年度差异则对功能群多样性有显著影响。微生境起着关键作用：植物病原体，尤其是与葡萄藤干病相关的种类，在树皮和木质部中最为常见；真菌寄生菌在树皮中占主导地位；广食性腐生菌在土壤和树皮中较为普遍；与葡萄藤干病相关的木质部腐生菌在树皮中数量最多。土壤中的真菌多样性总体最高。植株健康状况仅对葡萄藤干病病原体有显著影响，这类病原体在患病葡萄藤中的数量和多样性更高。品种则仅影响与葡萄藤干病相关的木质部腐生菌的多样性。

结论

年份是影响植物组织及土壤中真菌群落组成的重要因素，它会导致真菌群落发生最显著的变化。非生物因素（年份和季节）与土壤中的真菌群落关联最为密切，而生物因素（品种和植株健康状况）则对与葡萄藤组织相关的真菌影响更大。这些研究结果强调了微生境和时间变化在塑造葡萄藤真菌群落结构中的核心作用。