甲基化对miR-379/656（C14MC）簇肿瘤抑制功能的调控及其在肝细胞癌中的临床应用价值

《BMC Cancer》：Methylation-mediated regulation of tumor-suppressor function of the miR-379/656 (C14MC) cluster and its clinical utility in hepatocellular carcinoma

　　

摘要

背景

肝细胞癌是导致癌症相关死亡的主要原因之一。多种微小RNA在肝细胞癌的发生与发展中起着关键作用。DNA甲基化等表观遗传过程可能在肝细胞癌的发病过程中调控这些RNA。本研究表明，miR-379/656基因簇/C14MC具有肿瘤抑制功能，且受DNA甲基化的表观遗传调控。

方法

通过nCounter检测法以及TCGA-LIHC临床数据集，研究了肝细胞癌细胞系中C14MC微小RNA的表达情况。通过克隆和荧光素酶实验确定了C14MC的潜在启动子，并利用亚硫酸盐Sanger测序法分析了启动子区域CpG序列的甲基化状态。通过转录组测序或转染模拟分子后再进行qRT-PCR验证，确认了C14MC靶基因的表达情况。此外，还利用TCGA-LIHC临床数据评估了C14MC及其靶基因相互作用网络在肝细胞癌诊断和预后中的意义。

结果

在肝细胞癌细胞系及TCGA-LIHC数据集中，C14MC的表达水平均降低。C14MC的肿瘤抑制功能丧失是由启动子区域CpG序列的过度甲基化直接导致的。通过转染模拟分子重新激活特定的C14MC微小RNA，如miR-299-5p和miR-376c-3p，可抑制包括PARP1、SPP1、RAD21和CENPA在内的多个靶致癌基因的表达，而这些基因参与调控肝细胞癌中的p53信号通路和NF-κB信号通路等重要分子途径。此外，过表达这些微小RNA还能抑制肝细胞癌细胞的迁移和侵袭能力。同时，C14MC及其靶基因相互作用网络与肝细胞癌患者的生存率之间存在显著关联。

结论

这是首项表明C14MC是肝细胞癌中依赖甲基化调控的基因簇的研究。这些微小RNA及其靶基因可用于肝细胞癌的早期诊断和预后评估。因此，针对C14MC进行干预可能有助于肝细胞癌的治疗与管理。

图形摘要

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