他克林-磺酰胺杂合物作为强效乙酰胆碱酯酶抑制剂的设计、合成与生物学评价

《RSC Advances》:Design, synthesis and biological evaluation of tacrine-sulphonamide hybrids as a potent acetylcholinesterase inhibitor

【字体: 时间:2026年06月14日 来源:RSC Advances 4.6

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  研究人员设计并评估了新型他克林(tacrine)基磺酰胺(sulphonamide)衍生物抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)的能力,采用分子对接(molecular docking)和体外实验(in vitro assays)。对接研究显示,这些化合物通过π-π堆积

  
研究人员设计并评估了新型他克林(tacrine)基磺酰胺(sulphonamide)衍生物抑制乙酰胆碱酯酶(AChE)的能力,采用分子对接(molecular docking)和体外实验(in vitro assays)。对接研究显示,这些化合物通过π-π堆积、π-阳离子相互作用、氢键(hydrogen bonding)和疏水接触(hydrophobic contacts),与关键活性位点残基(包括Trp86、Trp286、Tyr337和Phe338)形成强相互作用。在合成的化合物中,化合物7、4、8和11表现出优越的结合亲和力,其中化合物7的对接得分最高(?9.18 kcal mol?1),结合能为?97.92 kcal mol?1。使用Ellman法进行的体外筛选证实了纳摩尔(nM)范围内的强效AChE抑制活性,半数抑制浓度(IC50)值处于纳摩尔水平。结构-活性关系(SAR)分析表明,甲基取代的哌啶(piperidine)衍生物显著增强了抑制效能,其中化合物10和11的IC50值分别达到7.40 nM和11.33 nM。
**论文解读:他克林-磺酰胺杂合物作为强效乙酰胆碱酯酶抑制剂的设计、合成与生物学评价**

**研究背景与问题**

阿尔茨海默病(Alzheimer's disease, AD)是一种进行性神经退行性疾病,约占全球痴呆病例的60%–70%。其病理特征包括细胞外β-淀粉样蛋白(amyloid-beta, Aβ)斑块和细胞内过度磷酸化tau蛋白形成的神经原纤维缠结,导致突触功能障碍、神经元死亡和脑萎缩。临床上,AD主要影响65岁以上人群,表现为认知能力逐渐下降、记忆丧失、判断力受损、语言缺陷及行为异常。全球痴呆症患者数量预计将从2019年的约5500万增至2050年的1.39亿,凸显了开发有效治疗策略的紧迫性。

乙酰胆碱酯酶(acetylcholinesterase, AChE)是中枢神经系统中调节乙酰胆碱(acetylcholine, ACh)介导的神经传递的关键酶,其结构包含两个结合位点(催化活性位点CAS和外围阴离子位点PAS),由狭窄的峡谷区连接。AChE是AD治疗的主要药理学靶点。他克林(tacrine)是首个获批用于AD治疗的AChE抑制剂,但因剂量依赖性肝毒性而退市。尽管如此,他克林因其明确的药效团和同时与AChE的CAS及PAS相互作用的能力,仍被作为设计新型多靶点导向配体(multitarget-directed ligands, MTDLs)的核心骨架。近年来,研究人员合成了多种他克林衍生物,如他克林-2-酰胺、他克林-褪黑素杂合物、多奈哌齐-他克林支架等,旨在增强治疗潜力。

**研究目的**

本研究旨在扩展前期工作,评估他克林-2-磺酰胺(tacrine-2-sulphonamide)衍生物的胆碱酯酶抑制活性、理化性质及分子结合相互作用。通过引入磺酰胺基团,利用其更强的电子吸引能力和氢键供/受体特性,期望获得比此前报道的酰胺衍生物更优的AChE抑制活性。

**主要关键技术方法**

研究人员采用以下主要技术方法:1)分子对接(molecular docking):使用Schr?dinger套件,以重组人乙酰胆碱酯酶(hAChE)与多奈哌齐的共晶结构(PDB ID: 4EY7)为模板,进行配体准备、受体网格生成和Glide评分计算;2)分子动力学模拟(molecular dynamics simulation, MDS):使用Desmond模块进行200 ns模拟,分析均方根偏差(RMSD)和均方根波动(RMSF),并通过MM-GBSA方法计算结合自由能;3)体外AChE抑制活性测定:采用Ellman法(AMPLITE? AChE assay kit),测定化合物在200 nM浓度下的抑制百分比并计算半数抑制浓度(IC50);4)ADME预测:使用QikProp模块评估类药性(Lipinski五规则、Jorgensen三规则)及血脑屏障(BBB)渗透性等;5)毒性预测:使用ProTox-3.0和ToxSTAR进行计算机毒性分析。

**研究结果**

**分子对接(Molecular docking)**

通过分子对接研究,化合物与AChE活性位点关键残基(Trp86、Trp286、His447、Phe338、Tyr337、Tyr341等)形成π-π堆积、π-阳离子相互作用、氢键和疏水接触。化合物7表现出最佳的Glide得分(?9.18 kcal mol?1)和结合能(?97.92 kcal mol?1),与Trp286形成两个π-π相互作用,并与Ala343形成两个强氢键。化合物4的Glide得分为?7.82 kcal mol?1,结合能?94.79 kcal mol?1,与Trp86、Tyr337、Phe338相互作用。化合物8(Glide得分?6.97 kcal mol?1,结合能?90.65 kcal mol?1)与Trp286形成π-π相互作用,与Tyr72和Phe295形成氢键。总体而言,化合物4、7、8、11显示出最高的结合亲和力。

**AChE抑制活性筛选及IC50测定**

采用Ellman法对所有合成化合物进行AChE抑制活性评估,IC50值均在纳摩尔范围。化合物10和11(甲基取代哌啶衍生物)表现出最强的抑制活性,IC50分别为7.40 nM和11.33 nM,远优于他克林(94.69 nM)。结构-活性关系分析表明:给电子基团(如对甲苯磺酰胺中的甲基)增强疏水相互作用,提高效能(化合物1,IC50=31.39 nM);强吸电子基团(如硝基)降低π-π堆积能力,导致活性下降(化合物2和3,IC50分别为412.84 nM和211.68 nM);甲氧基虽为给电子基但因位阻和极性干扰活性(化合物4,IC50=436.07 nM);萘基提供扩展芳香表面积增强π-π堆积(化合物6,IC50=53.01 nM);吗啉基团引入极性和氢键潜力但疏水匹配差(化合物7,IC50=188.02 nM);哌啶环上的甲基取代显著提高脂溶性和构象刚性,是优化效能的关键策略(化合物8–11,IC50范围7.40–53.38 nM)。

**对接得分与IC50的相关性**

化合物7的对接得分(?9.18)与IC50(7.40 nM)高度一致。化合物11(IC50=11.33 nM)的对接得分(?6.97)也表现出良好的预测能力。但部分化合物存在偏差,例如化合物3(结合能?64.98,IC50=356.95 nM)表明对接可能未完全捕捉构象柔性或溶解度效应。总体而言,对接模拟为结合亲和力提供了有价值的初步信息,但实验验证不可或缺。

**计算机模拟理化性质(ADME)预测**

所有衍生物均满足Lipinski五规则和Jorgensen三规则,类药性良好。中枢神经系统(CNS)靶向化合物的参数通常较低。化合物通过Caco-2细胞渗透性(QPPCaco)和MDCK细胞渗透性(QPPMDCK)评估,显示适当的渗透性。血脑屏障渗透性(QPlogBB)预测值在合理范围。

**计算机模拟毒性预测**

大多数化合物显示一致的呼吸毒性、BBB渗透性和肝脏相关毒性预测。化合物2和3被预测具有致癌性和致突变性风险。化合物8、9和标准品(他克林)显示出额外的神经毒性或免疫毒性。肝毒性(胆汁淤积、肝硬化、脂肪变性)在多个化合物中有提示,但肝炎风险未出现。总体而言,肝、肾、心脏、细胞毒性和致突变性风险较低,但呼吸毒性和肝脏效应需进一步实验验证。

**RMSD和RMSF分析**

对7个衍生物进行了200 ns分子动力学模拟,蛋白质-配体复合物的平均RMSD为1.87 ± 0.20 ?,表明整体结构稳定。平均RMSF为0.84 ± 0.56 ?,反映残基水平柔性稳定。MM-GBSA计算结合自由能显示:化合物11结合能最强(?106.53 kcal mol?1),主要由脂溶性贡献驱动;化合物7结合能为?100.68 kcal mol?1,库仑和溶剂化效应平衡;化合物8结合能?95.70 kcal mol?1,库仑稳定化增强。所有七个衍生物的结合能均高于50 kcal mol?1,证实了稳定的结合。

**讨论与结论**

本研究报告了他克林-磺酰胺杂合物的合成及其作为AChE抑制剂的评价。甲基取代的哌啶衍生物(化合物10和11)表现出最强的抑制效能(IC50分别为7.40 nM和11.33 nM),成为最有前景的候选化合物。计算研究表明,这些化合物与AChE活性位点关键残基(Trp86、Trp286、Tyr337、Phe338)通过π-π堆积、π-阳离子相互作用、氢键和疏水力形成强结合。与前期报道的酰胺衍生物相比,磺酰胺衍生物显示出更强的抑制活性,这可能归因于磺酰基更强的吸电子效应,从而增加氢键潜力并调节极性。此外,磺酰胺作为比酰胺更强的氢键供体和受体,可改善与AChE催化残基和外围残基的相互作用。总体而言,这些发现表明,基于他克林的磺酰胺衍生物(尤其是化合物10和11)是高效的AChE抑制剂,具有进一步治疗开发的潜力。
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