糖尿病周围神经病变中的全转录组测序与ceRNA调控网络

《Scientific Reports》：Whole transcriptome sequencing and ceRNA regulatory network in diabetic peripheral neuropathy

　　

摘要

尽管糖尿病周围神经病变是一种严重的糖尿病并发症，但其分子机制至今仍不清楚。因此，本研究的目的是通过全转录组测序进一步探讨糖尿病的发病机制。方法：我们对Sprague–Dawley大鼠的坐骨神经样本进行了全转录组测序。根据全转录组测序数据，识别出糖尿病周围神经病变组与对照组之间差异表达的基因，并分析了这些差异基因所涉及的函数和信号通路。随后构建了蛋白质-蛋白质相互作用网络，利用STRING算法筛选出了排名前20的枢纽基因。接着对这20个枢纽基因进行了富集分析。最后建立了竞争性内源RNA网络。结果：糖尿病周围神经病变组与对照组之间存在597个差异表达基因，排名前20的枢纽基因为Fos、Tnf、Jun、Cd3e、Cd79a、Cd27、Cd79b、Ptprc、Cd22、Cd40lg、Cd19、Cr2、Sell、Il6、Pdlim3、Actn2、Myom2、Tnni2、Ldb3和Myh7。富集分析显示，这些差异表达基因和枢纽基因与“B细胞受体信号通路”、“TNF信号通路”、“T细胞受体信号通路”、“Th17细胞分化”、“IL-17信号通路”、“原发性免疫缺陷”以及“Toll样受体信号通路”相关。最终构建的竞争性内源RNA网络包含9种mRNA、23种miRNA和23种lncRNA。结论：本研究确定，Fos和Jun等枢纽基因可能通过调控B细胞受体信号通路、TNF信号通路和IL-17信号通路等参与糖尿病周围神经病变的进展。本研究的结果可为了解差异表达基因在糖尿病周围神经病变发病机制中的作用提供新的见解。