从抽取的深海水中提取的环境DNA有助于监测深海鱼类的多样性

《Scientific Reports》：Environmental DNA from pumped deep-sea water enables monitoring of deep-sea fish diversity

　　

摘要

监测深海生物多样性颇具挑战性，因为传统的采样方法和视觉调查需要大量的后勤支持。环境DNA为检测海洋生物提供了另一种途径；然而，其在深海生态系统中的应用却受到采样难度的限制。由于长距离运输对环境DNA的影响尚不明确，我们对比了两种深海水样采集方法：抽吸式深海水采样法与使用尼斯金瓶在进水口附近采集水样的方法。样本取自日本相模湾和骏河湾的抽水站，同时通过带饵相机观测来验证基于环境DNA的检测结果。在相模湾，两种采样方法检测到的鱼类种类数量相近；而在骏河湾，尼斯金法的物种多样性更高，数据积累曲线也更陡峭。所鉴定物种的栖息深度与两个海湾的进水深度一致，这证明了抽吸式采样方法的有效性。两种方法检测到的鱼类群落组成有较大重叠，带饵相机在相模湾和骏河湾分别记录到了11种和17种鱼类，其中7种和10种与环境DNA检测结果一致。这些研究结果表明，对抽吸式采集的深海水进行环境DNA测序是一种可行的深海鱼类生物多样性监测方法。