通过计算方法识别抗原，并开发针对加德纳菌性阴道病的多表位疫苗

《Amino Acids》：Computational identification of antigens and development of a multi-epitope vaccine for bacterial vaginosis caused by Gardnerella vaginalis

　　

摘要

细菌性阴道病是一种常见的阴道菌群失调疾病，主要由阴道加德纳菌引起。该病的发病率不断上升，引发了全球健康领域的担忧，因此亟需一种能够增强人体免疫力并降低疾病传播风险的疫苗。本研究采用免疫信息学方法，开发了一种针对细菌性阴道病感染的多表位疫苗。通过IEDB推荐的服务器和NetCTL工具，识别出了B细胞表位和T细胞表位：其中HTL表位是针对HLA-DR等位基因（包括DRB1<01:01>、DRB103:05和DRB104:04）预测得到的，而CTL表位则是针对HLA I类超型（包括HLA-A02:01和HLA-A*01:01）预测得到的。选定的这些表位通过佐剂和连接子被融合在一起。来自结核分枝杆菌热休克蛋白60的肽序列MSPSVRHSPSVRH被用作佐剂，可通过TLR2/4通路激活先天免疫反应，并促进树突状细胞的成熟。B细胞表位与CTL或HTL表位之间使用GGGS连接子相连，而CTL+HTL表位则通过HEYGAEALERAG连接子连接。其他表位的选取则是基于其抗原性、致敏性及免疫学特性。TLR2能够识别细菌脂蛋白和肽聚糖，在分子对接实验中，TLR2与TLR-4之间存在较强的相互作用。本研究结果表明，所制备的疫苗具有稳定性，其分子量为49924.79道尔顿，抗原性值为1.37；此外，该疫苗还具有稳定性和碱性，不稳定性评分仅为32.65，预计等电点为5.09。其预期二级结构中，94.57%为随机卷曲结构，5.43%为伸展链结构。该疫苗能够高效地与TLR2和TLR4受体结合，产生的范德华能量分别高达(-97.2 +/- 5.9)和(-67.6 +/- 7.3)千卡/摩尔。通过分子动力学模拟，进一步评估了这种多肽疫苗的稳定性和紧凑性，结果显示其具备良好的稳定性、表达能力、免疫刺激作用以及溶解性。