单基因疾病植入前遗传检测中等位基因丢失的系统性评估：发生率、检测方法及临床检测策略

《Fertility and Sterility》：Systematic assessment of allele dropout in preimplantation genetic testing for monogenic disorders: Incidence, detection, and clinical testing strategies

　　

张婷|张硕|何雅琼|陆瑶|牛一超|黄毅|杜彦志|张月萍|孙云

中国上海，上海交通大学医学院仁济医院，辅助生殖与生殖遗传学上海重点实验室，生殖医学科

摘要

目的

尽管针对单基因疾病的植入前遗传检测（PGT-M）已在临床实践中得到广泛应用，但直接变异检测中等位基因丢失的发生率及其临床意义仍缺乏充分研究。本研究旨在系统评估PGT-M中的等位基因丢失率，并探讨降低其影响的实用检测策略。

设计

回顾性研究。

研究对象

共纳入2020年12月至2025年9月期间接受PGT-M治疗的516对夫妇的胚胎样本。

检测方法

在囊胚发育的第5天或第6天进行滋养层活检，随后使用多重置换扩增技术（MDA）进行全基因组扩增。PGT-M检测策略包括两个部分：（1）定制的下一代测序（NGS）检测面板，可覆盖目标基因的外显子区域及邻近的单核苷酸多态性（SNPs），从而实现基于家族的单倍型关联分析并与胚胎中的直接变异检测相结合；（2）通过桑格测序对MDA检测产物中的直接变异进行检测。

主要结局指标

通过NGS检测面板和桑格测序直接检测到的PGT-M过程中的等位基因丢失率。

结果

结论

基于NGS的PGT-M检测面板不仅具有较低的等位基因丢失率，还能同时实现单倍型分析，因此可作为首选的一线检测方法。在临床实践中可不必常规使用桑格测序。若NGS检测面板的结果在直接变异检测与单倍型关联分析之间存在差异，可考虑通过针对性的桑格测序进行进一步验证。