通过虚拟筛选、分子对接、分子动力学、分子力学方法发现潜在的AXL抑制剂，并进行体外验证

《Scientific Reports》：Discovery of potential AXL inhibitors using virtual screening, molecular docking, molecular dynamics, molecular mechanics, and in vitro validation

　　

摘要

AXL在多种癌症中过度表达，包括乳腺癌、肺癌、结肠癌、骨肉瘤、肾癌、胃癌以及胶质瘤等。它与患者生存率较低有关，同时在癌细胞增殖、存活、肿瘤生长、进展及转移过程中起着重要作用。通过针对AXL的基因靶向研究，证实其是一个具有潜力的治疗靶点。在本研究中，我们采用了多种计算机模拟分析方法，包括虚拟筛选、分子对接、分子动力学模拟以及MM/GBSA计算，从各种小分子数据库中筛选潜在的AXL抑制剂。我们发现了位于AXL结合口袋中的关键氨基酸残基，如Met623、Pro621、Asp627和Asp690，这些残基通过氢键和π-π键与潜在抑制剂及阳性对照化合物发生相互作用。在体外实验中，三种候选化合物（STOCK1N-80636、STOCK1N-66436和Nebivolol）对四种不同的乳腺癌细胞系均显示出显著的抗增殖作用，其中STOCK1N-80636的效果最为显著。总之，通过计算机模拟和体外实验的结合，我们找到了潜在的AXL抑制剂。