摘要
SARS-CoV-2病毒不断进化，出现新的变异株，这对现有疫苗的效力构成了严重威胁。然而，针对由病毒突变（尤其是刺突蛋白的突变）导致的疫苗失效问题，一种有希望的解决方案是开发出具有抗变异能力、非刺突结构、多表位特性的通用纳米结构疫苗。这类疫苗应具备多功能性、生物相容性、自我佐剂作用，且在大小和形状上与病原体相似。本研究旨在设计一种自组装纳米结构疫苗，该疫苗包含五聚体和三聚体螺旋肽结构以及其他功能结构，如表位、TAT、PADRE以及佐剂。从IEDB数据库中筛选出了具有超过50%个体预测覆盖率的CTL、HTL和BL表位，然后通过连接子将这些表位融合起来以实现自组装。利用GalaxyHomomer和AlphaFold网络服务器对24种SANV单体的多聚化过程进行了建模。随后，分析了含有佐剂（SANVa9）和不含佐剂（SANVb6）的候选疫苗的理化特性，并评估了其抗原性、致敏性、溶解度及抗氧化能力。此外，还通过分子对接和模拟技术，在100纳秒的时间尺度上分析了SANVa9和SANVb6与广谱中和性sarbecovirus抗体5817以及TLR2、TLR3和TLR7之间的分子相互作用、特异性和稳定性。最后，通过对比分析发现，SANVa9和SANVb6相较于对照组能够引发更强、更广泛的免疫反应，这一结果可为后续的体外和体内研究提供依据，但在临床应用之前还需进一步验证。
