综述：人类肠道微生物组转化研究：缺失的拼图碎片是什么？

《Journal of Translational Medicine》：Translational human gut microbiome research: What are the missing pieces of the puzzle?

　　

摘要

背景

在过去的二十年里，人类肠道微生物组研究取得了显著进展，揭示了肠道微生物在人类健康与疾病中的重要作用。尽管有这些进步，但将其转化为基于证据的临床实践和公共卫生措施仍极为有限。这篇综合性的转化视角综述从四个关键方面对人类肠道微生物组研究进行了评估：转化成果、有效转化的障碍、其他医学学科框架的适用性以及推动转化进展的策略。

正文

人类肠道微生物组研究是依据转化医学研究原则来评估的，具体如下。(1) 通过分析基于微生物组或针对微生物组的主要方法的研发路径，探讨了人类肠道微生物组研究中的转化成果，这些方法包括粪便微生物群移植、益生菌、后生元、益生元以及饮食干预等，不过整体上在临床和公共卫生领域的应用仍然有限。(2) 已有的转化医学研究框架为识别当前人类肠道微生物组研究中的缺失要素提供了基础，这些要素包括从T0到T4阶段的进展、双向知识流动、优先考虑未得到满足的患者和社会健康需求、以患者为中心的方法、利益相关者参与以及跨学科合作。结合人类肠道微生物组研究的特定特征、挑战和局限性，对这些原则的整合进行了讨论。(3) 除了转化医学原则整合不足之外，还分析了人类肠道微生物组研究中的转化障碍。这些障碍源于肠道微生物组的固有复杂性和高维度特性、时间与个体间的差异、混杂因素、方法学标准化和验证的不一致性，以及研究工作的碎片化。所有这些障碍都妨碍了因果推断，导致了证据质量较低，进而限制了有效的转化应用。(4) 基于前述研究结果，提出了一种推动人类肠道微生物组研究转化的框架，其中包括为肠道微生物组研究人员提供转化研究原则方面的教育和培训等战略重点。

结论

人类肠道微生物组研究大多仍处于早期转化阶段，由于内在和方法学上的障碍，难以进行有效的转化，这些障碍妨碍了因果推断和高质量证据的生成。整合核心的转化医学研究原则可为弥补这些差距提供途径，而针对肠道微生物组研究人员开展教育和培训则是推动转化进展的关键任务。