西班牙痴呆症患者的拷贝数变异谱系

《npj Genomic Medicine》：Landscape of copy number variants in Spanish people with dementia

　　

摘要

最新研究表明，拷贝数变异（CNVs）可能影响阿尔茨海默病（AD）及相关痴呆症（ADRD）等复杂疾病的遗传率。我们利用来自西班牙人群的GR@ACE/DEGESCO痴呆症数据集（n?=?20,067）中的基因分型数据（Axiom 815?K西班牙生物样本库芯片），进行了CNV分析。通过PennCNV工具及严格的质量控制，最终选出8275名对照组受试者和7818名痴呆症病例，用于分析基因层面的病例/对照组关联。我们共发现了43,833个CNV，其中缺失型占47%，重复型占53%。虽然未发现全基因组范围内的显著关联，但在PKP3-SIGIRR和FBRSL1基因位点上观察到了统计学上的关联。有2970个基因的CNV仅出现在痴呆症病例中，且这些基因多与血管相关通路有关。值得注意的发现包括ADRD病例中的14q11.2区域重复以及VPS13B基因缺失，后者已通过光学基因组测序得到证实。我们的研究结果表明，西班牙人群中可能存在与ADRD相关的新型基因。不过，基于芯片的技术在检测CNV方面的分辨率有限，因此还需要进一步研究。