利用PacBio HiFi和Omni-C测序技术完成南非莫桑比克罗非鱼（Oreochromis mossambicus）的染色体级基因组组装

《Scientific Data》：Chromosome-Level Genome Assembly of Southern Africa Mozambique Tilapia (Oreochromis mossambicus) using PacBio HiFi and Omni-C sequencing

　　

摘要

莫桑比克罗非鱼（Oreochromis mossambicus）是南部非洲具有重要生态和经济价值的物种。然而，城市化进程及水资源管理方面的问题导致该物种被国际自然保护联盟列为濒危物种。尽管这种鱼分布广泛且是重要的食物来源，但南部非洲地区的O. mossambicus的遗传结构仍缺乏充分研究。这一知识空白阻碍了对该物种的有效保护和管理工作。本研究利用PacBio HiFi和Dovetail Omni-C测序技术，为南非地区的O. mossambicus构建了高质量的染色体级基因组序列。所构建的基因组大小为1.09吉巴，连续性很高（Contig N50为35.6兆巴，scaffold N50为42.8兆巴），99.4%的序列可定位在22条染色体上，BUSCO完整性达97.5%。我们共注释出了27,544个蛋白质编码基因。该基因组为保护当地生物多样性以及在南非水产养殖领域通过基因组选择培育抗病性和生长性能更优的鱼类提供了重要资源。