基于贝叶斯方法的KCNV2相关视网膜病变人群患病率估计:俄罗斯人群与全球人群中疾病相关变异频率的比较分析
《International Journal of Molecular Sciences》:Bayesian Population-Based Prevalence Estimation of KCNV2-Associated Retinopathy: A Comparative Analysis of Disease-Associated Variant Frequencies in Russian and Global Populations
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时间:2026年07月01日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
具有超常杆状细胞反应的锥形细胞营养不良(CDSRR)是一种罕见的常染色体隐性遗传性视网膜营养不良,其病因是KCNV2基因的双等位基因变异。由于目前的估算依赖于临床确诊病例,因此准确的患病率数据仍然有限。本研究旨在通过整合经过筛选的变异证据以及大规模群体基因组学资源来估算该病的群体患病率。本研究的关键方法特点是采用了多层致病性框架,并结合生物学上合理的患病率范围进行估算:已知的致病变异可得出较为保守的估算值,而可能致病的变异以及意义不明的强变异则可得出更广泛的估算值。研究分析了gnomAD数据库中的807,162名个体以及GDB和EvogenDB中的144,127个俄罗斯人的基因组中的等位基因频率。研究应用贝叶斯框架,根据不同层级变异的携带者频率来计算疾病患病率。基于已知致病变异的保守估算值为,全球范围内为1/343,926,而在俄罗斯则为1/1,911,347。若纳入更广泛的变异层级,估算值则分别上升至1/14,620和1/32,764。与之前通过临床诊断得出的1/865,000的患病率相比,这些估算值给出了更宽的生物学上合理的患病率范围,同时也与临床诊断可能存在的漏诊情况相符。这种基于层级的方法能够在估算罕见疾病患病率时考虑变异分类的不确定性。
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