基于扩增子的下一代测序检测与免疫组化染色在检测非小细胞肺癌中间变性淋巴瘤激酶融合基因方面的比较:一项大型单中心队列研究

《Cancers》:Comparison of Amplicon-Based Next-Generation Sequencing Testing and Immunohistochemical Staining in Detecting Anaplastic Lymphoma Kinase Fusion Genes in Non-Small-Cell Lung Cancer: A Large Single-Centre Cohort Study

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年07月02日 来源:Cancers 4.8

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   简要总结 全面的下一代测序技术已成为识别非小细胞肺癌中具有临床意义的驱动基因突变的标准方法。然而,由于技术限制,基于扩增子的RNA测序在部分病例中可能无

  

简要总结

全面的下一代测序技术已成为识别非小细胞肺癌中具有临床意义的驱动基因突变的标准方法。然而,由于技术限制,基于扩增子的RNA测序在部分病例中可能无法检测到ALK融合基因。在本研究中,我们对919名非小细胞肺癌患者进行了ALK免疫组化检测与基于扩增子的NGS检测的对比分析,结果发现两种方法的检测一致性很高。值得注意的是,有一例具有临床意义的ALK融合基因被基于扩增子的NGS检测遗漏,但被ALK免疫组化检测出来,并通过杂交捕获测序得到了确认。我们的研究结果也证实了先前的观察结果,即在没有ALK基因重排的情况下,肺神经内分泌癌也可能出现ALK免疫组化检测的假阳性现象,这提示了一个重要的诊断误区。这些结果支持在那些术前就很可能存在ALK基因重排的患者中,将ALK免疫组化检测作为补充检测手段,或者在多重分子检测失败后使用该检测方法。

摘要

背景/目的: 间变性淋巴瘤激酶(ALK)融合是一种驱动基因易位,存在于3–5%的非小细胞肺癌患者中。基于下一代测序技术的检测方法是识别具有临床意义基因突变的标准手段,但假阴性问题依然存在。免疫组化染色则是另一种可靠、快速且成本低廉的检测ALK融合的方法。尽管已有研究显示其检测结果与NGS检测高度一致,但仍需进一步研究以得出明确结论。方法:本研究对2019年8月8日至2025年4月11日期间在我院接受过Oncomine Dx Target Test(ODxTT)检测以及ALK免疫组化检测的非小细胞肺癌患者进行了回顾性分析,该检测是一种基于扩增子的DNA和RNA下一代测序检测方法。结果:在纳入研究的919名患者中,有30名(3.26%)患者的检测结果显示存在ALK融合基因,而ALK免疫组化检测则显示35名(3.80%)患者呈阳性。两种检测方法的结果一致性为99.4%,κ系数为0.920。对于ODxTT检测而言,ALK免疫组化检测的灵敏度、特异性、阳性预测值和阴性预测值分别为100%、99.4%、85.7%和100%。有5名患者的检测结果不一致,表现为NGS检测为阴性而免疫组化检测为阳性。在这5例不一致病例中,1例为NGS检测假阴性,其余4例则为ALK免疫组化检测假阳性,其中3例为神经内分泌癌患者。结论:ALK免疫组化检测的诊断准确性可与ODxTT检测相媲美,但对于非腺癌患者而言,需要谨慎解读检测结果。我们的研究结果表明,ALK免疫组化检测可作为一种与基于NGS的检测方法相辅相成的检测手段,尤其适用于那些术前就很可能存在ALK融合基因的患者。
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