摘要
线粒体异常与多种癌症密切相关，但与线粒体通路相关的基因在卵巢癌中的作用仍不明确。本研究旨在从单细胞和转录组层面识别与卵巢癌预后相关的线粒体通路相关基因。研究获取了公共数据集（GSE184880、GSE54388、GSE18520、TCGA-OV）。通过GSE184880确定了潜在的细胞亚群及其肿瘤与对照组的差异表达基因，再与GSE54388中的关键模块基因进行交叉分析，得到候选基因。随后通过单变量Cox回归和LASSO分析筛选预后基因，并基于这些基因构建并验证了预后风险模型。此外还对这些预后基因进行了功能及定位分析、调控网络构建、免疫浸润分析、药物预测以及表达验证。在单细胞层面还进行了伪时间分析、细胞通讯分析和表达分析。为考虑患者个体差异，采用了基于MAST方法的混合效应模型。同时进行了针对线粒体功能通路的靶向GSEA分析，包括临床相关性分析、独立预后分析以及计算功能推断。通过细胞聚类和注释共识别出8种细胞类型，其中内皮细胞、成纤维细胞、NK细胞和组织干细胞被视为潜在的细胞亚群。TK1、VWF、CPXM1、WIPF3、APOLD1、MGST2和PPA1被确定为预后基因，基于这些基因构建的风险模型具有较好的性能和普适性。混合效应模型分析表明，在调整患者个体差异后仍有1200个差异表达基因保持显著，这进一步证明了单细胞研究结果的可靠性。这些预后基因在体外表现出不一致的表达模式，但仍能作为患者生存情况的良好预测因子，可能在关键细胞的分化与发育中发挥重要作用。靶向GSEA分析显示，高风险组中线粒体呼吸（电子传递链/氧化磷酸化）和线粒体自噬显著受抑，而线粒体融合/分裂及活性氧相关通路则未达到显著水平。在GSE184880数据集中，PPA1在多种细胞类型中均有高表达；而在GSE54388数据集中，CPXM1和WIPF3在肿瘤组中显著下调，其他预后基因则表现出相反的表达模式。单细胞功能推断结果显示，TK1和APOLD1在G2/M期高表达，而MGST2、PPA1、VWF、CPXM1和WIPF3则在G1期表达较多。VWF与PI3K-AKT通路的正相关程度最高。临床验证表明，这一特征在晚期卵巢癌（FIGO III/IV期）中具有独立的预后价值。本研究在卵巢癌中发现了7个与线粒体通路相关的预后基因，这些基因的生存率及体外表达模式均不统一，为寻找潜在治疗靶点提供了新的参考。
图表摘要
该图表摘要展示了如何通过单细胞与转录组整合分析、预后模型构建，以及调控网络、免疫浸润和治疗靶点的研究，识别出7个与卵巢癌相关的线粒体预后基因。
利益冲突声明
作者声明不存在利益冲突。
数据可用性说明
本研究中的原始数据已包含在文章的支持信息部分。如有进一步疑问，可联系相应作者。
