王蛇（Elaphe carinata）的染色体级参考基因组组装序列

《Scientific Data》：A chromosome-level reference genome assembly of the King Ratsnake (Elaphe carinata)

　　

摘要

王蛇（Elaphe carinata）是东亚地区广泛分布的一种非蝰蛇科蛇类，它具有出色的广谱抗毒能力，能够捕食其他蛇类，包括致命的蝰科和眼镜蛇科物种。尽管其在生态和生理上具有重要意义，但这一特性的遗传基础至今仍不甚明了。在此，我们利用PacBio HiFi长读长测序、Illumina短读长数据以及RNA-seq技术，结合与王蛇亲缘关系较近的Elaphe schrenckii作为参照，构建了王蛇的染色体级基因组图谱。该基因组图谱的大小为1.62Gb，其中contig的N50值为2.77Mb，scaffold的N50值为143.07Mb，BUSCO完整性达97.3%，超过90%的序列被定位在18个假染色体上。重复序列占基因组的53.19%，其中LINE元素最为常见。我们共注释了19,750个蛋白质编码基因，其中99.2%的基因通过同源性分析、转录组学数据以及从头预测等综合证据确定了功能。这一高质量的基因组资源为研究蝰蛇科的进化、抗毒机制以及新型抗毒疗法的开发提供了重要基础。