建立与甜瓜氮利用效率相关的比较转录组数据集

《Scientific Data》：Establishment of comparative transcriptome dataset related to nitrogen use efficiency in melon

　　

摘要

氮利用效率是影响甜瓜（Cucumis melo var. saccharinus）产量形成与资源利用的关键生理性状。为阐明不同甜瓜品种间氮利用效率差异的分子机制，我们对在高氮和低氮条件下生长的四种自交系——氮利用效率高的T514和T55，以及氮利用效率低的T213和T23进行了转录组分析。在果实膨大期共采集了24份叶片样本，通过Illumina RNA-seq技术获得了160.31 Gb的高质量测序数据，基因定位效率超过94%。我们注释出了26,222个表达基因，其中包括644个新预测的基因，从而构建了最完整的转录组数据集。皮尔逊相关分析和主成分分析表明，样本重复性良好，且不同种质材料及氮处理之间的转录组差异十分明显。差异表达分析显示，在8组两两比较中均有824个核心差异表达基因与氮利用效率相关。其中6个具有代表性的差异表达基因通过RT-qPCR得到了验证，其结果与RNA-seq数据高度一致。这些研究结果为提高甜瓜的氮利用效率提供了宝贵的分子资源，有助于减少肥料使用量并提升产量。