亨廷顿病大脑的多区域单核团图谱

《Scientific Data》：A Multi-Regional Single-nucleus Atlas of the Huntington’s Disease Brain

　　

摘要

亨廷顿病是一种神经退行性疾病，其病因是HTT基因中的CAG三核苷酸重复序列异常扩展。由于这种疾病较为罕见，相关研究在很大程度上依赖于死后脑组织的捐赠，而这些样本虽然极为宝贵，却很难获取。尽管已有许多研究发表了来自亨廷顿病患者脑组织的单核RNA测序数据，但这些数据仍分散在各种公共数据库中。缺乏标准化的元数据和分析流程，阻碍了这些资源的整合与再利用。为了解决这一难题，我们整合了39名亨廷顿病患者和34名健康对照者的104份组织样本，构建了一个涵盖六个脑区的、经过精心整理的多脑区单核参考图谱，这六个脑区分别是纹状体（尾状核和壳核）、前额叶皮层、扣带回皮层、伏隔核、海马体和小脑。该图谱包含了330,892个细胞，这些细胞都经过了标准化的质量控制、批次效应校正以及细胞类型标注。我们在此首次提出了大规模、多脑区的亨廷顿病单核参考图谱，为科研界提供了宝贵的资源。它将为深入研究亨廷顿病中不同细胞类型的分子机制奠定重要数据基础，有助于跨脑区进行实验验证，并有助于发现新的治疗靶点。