意大利中部萌芽栗林的遗传多样性及基于SSR技术的木材溯源应用
《Plants》:Genetic Diversity in Coppice Chestnut Forests in Central Italy and Potential Use of SSR-Based Timber Traceability
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时间:2026年07月04日
来源:Plants 4.1
摘要
甜栗(Castanea sativa Mill.)灌木林是地中海地区重要的资源,但目前对当地灌木林的遗传结构研究还不够充分,这限制了其作为木材来源研究的参考系统。本研究结合群体遗传分析、木材DNA提取优化以及基于参考系的分类方法,对拉齐奥地区的灌木林进行了评估,并检测了木材样本的宣称来源。研究对拉齐奥地区的4个种群在12个SSR位点上进行了基因分型,检测了哈代-温伯格不平衡、无效等位基因以及亲缘结构,同时利用5个共有位点将它们与欧洲/地中海地区的8个种群进行了比较。通过CTAB-PEG流程优化了从干燥木材中提取DNA的方法,然后使用监督DAPC、包含种群信息的STRUCTURE算法以及GDA_NT贝叶斯分类和排除测试,对来自4家锯木厂的40个木材样本进行了来源判定,其中2个样本宣称来自拉齐奥(MCt和RPt),1个来自卡拉布里亚(CALt),1个来自法国(FRAt)。拉齐奥地区的灌木林虽然具有较高的SSR多样性,但存在杂合子缺乏现象以及较细化的家族结构;因此,在后续分析中使用了经过筛选的COLONY数据集。拉齐奥地区的不同灌木林之间的差异较小,但在现有的欧洲/地中海参考集中,它们表现出与意大利中部的密切关联。优化后的方法能够从所有木材样本中获得可重复的SSR谱型,木材提取成功率可达80.0%。在现有的参考体系中,MCt和RPt与拉齐奥地区的来源相符,而CALt和FRAt则与拉齐奥地区的参考标准不符,应被视为来自其他地区或当前参考体系未能充分覆盖的样本。SSR标记可作为区域栗木筛查的实用工具,不过为了更精确地推断木材来源,还需要更广泛的参考体系以及更高分辨率的标记。
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