靶向长读长测序技术有助于全面分析遗传性肌病的基因与表观遗传特征

《Nature Communications》：Targeted long-read sequencing enables comprehensive analysis of the genetic and epigenetic landscape of inherited myopathies

　　

摘要

导致遗传性肌病的基因变异在类型、大小和序列背景上差异很大，包括小的序列变异、大的结构变异、重复序列扩展，以及更为复杂的事件，比如导致面肩肱型肌营养不良的D4Z4巨卫星序列收缩和低甲基化现象。使用下一代测序技术和其他较旧的分子技术来分析这些变异往往十分困难。为了解决这一问题，我们开发了一种针对性的长读长测序方法以及生物信息学分析框架，能够检测到目前与遗传性肌病相关的所有基因、变异和表观遗传特征。将该方法应用于一组肌病患者后，我们证明了该分析方法的有效性，其准确性和分辨率均优于现有方法。在经过标准临床基因检测仍无法确诊的患者中，有35.5%（11/31）通过我们的方法得到了新的基因诊断结果。这一方法为遗传性肌病的全面基因和表观遗传特征分析提供了一种简化的解决方案。