基于适配体-血红素/G-四链体识别和超分支滚环扩增的肌酸激酶同工酶MB检测方法研究

《ACS Measurement Science Au》:A Hyperbranched Rolling Circle Amplification Assay Using Aptamer–Hemin/G-Quadruplex Recognition for the Detection of Creatine Kinase-MB

【字体: 大 中 小 】 时间:2026年07月06日 来源:ACS Measurement Science Au 14.7

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  肌酸激酶-心肌带(CK-MB)仍然是急性心肌梗死早期诊断和临床管理的重要生物标志物。研究人员报道了一种基于构象锁定适配体G-四链体(G-quadruplex)系统结合磁纳米颗粒捕获和超分支滚环扩增(HRCA)的灵敏比色检测方法。靶标结合诱导适配体构象解锁,启动

  
肌酸激酶-心肌带(CK-MB)仍然是急性心肌梗死早期诊断和临床管理的重要生物标志物。研究人员报道了一种基于构象锁定适配体G-四链体(G-quadruplex)系统结合磁纳米颗粒捕获和超分支滚环扩增(HRCA)的灵敏比色检测方法。靶标结合诱导适配体构象解锁,启动HRCA介导的信号扩增,并在显色底物存在下产生浓度依赖性的比色响应。研究人员采用紧凑型三维打印成像模块结合基于Python的处理流程,从检测图像中提取灰度强度值进行定量分析。该检测方法仅需25 μL样品,在水相样品中检出限(LOD)为0.268 ng/mL,在加血样品中为0.328 ng/mL;定量限(LOQ)分别为0.89 ng/mL和1.09 ng/mL,线性动态范围为0.5–100 ng/mL。灰度强度与CK-MB浓度呈负相关,可在临床相关水平范围内实现定量检测。研究人员进一步通过TapeStation凝胶电泳验证了HRCA扩增过程和靶标诱导激活机制,确认了扩增DNA纳米结构的形成。该平台为CK-MB检测提供了一种低体积、基于扩增的策略,兼容简易光学读数,在即时检测(POC)应用中具有良好潜力。
该研究发表于《ACS Measurement Science Au》。研究背景方面,急性心肌梗死(AMI)是紧急就诊和死亡的主要原因之一,据美国心脏协会(AHA)2025年更新数据,美国每年约有805,000例心肌梗死发生。AMI的初始评估依赖心电图(ECG),其对ST段抬高型心肌梗死(STEMI)高度有效,但对于非ST段抬高型心肌梗死(NSTEMI)敏感性显著降低,因此生化心脏标志物与ECG联合使用成为确诊AMI的标准手段。目前,心肌肌钙蛋白(cTnI和cTnT)是诊断AMI的金标准,但其浓度通常在症状发作后16–30小时才达峰值,限制了其在早期检测中的应用。肌酸激酶同工酶MB(CK-MB)作为心肌富集型同工酶,在症状发作后3–6小时即可检出,12–24小时达峰,2–3天恢复基线,在识别急性心肌损伤和区分近期与既往梗死方面具有重要临床价值。人血清中CK-MB浓度低于约7 ng/mL视为正常,升高则提示心肌损伤。现有实验室检测方法如Roche Cobas e411虽具有高灵敏度,但需处理血清或血浆、专业人员操作、周转时间1–3小时,且依赖温度敏感试剂和大型仪器(>100 kg),限制了其在急诊场景中的应用。因此,开发适用于POC的CK-MB检测策略具有重要意义。

适配体(Aptamer)作为通过指数富集配体系统进化技术(SELEX)筛选获得的短单链DNA或RNA寡核苷酸,具有化学稳定性高、合成可重复性好、易于修饰等优势,已成为抗体的重要替代识别元件。构象锁定适配体设计基于分子信标结构,适配体最初与短互补封闭链杂交以稳定非活性构象,抑制非特异性靶标相互作用;靶标结合后适配体发生构象重排,置换封闭链从而激活靶标识别。然而,该机制产生的信号变化常不足以灵敏检测CK-MB等低丰度生物标志物。因此,研究人员将适配体与等温核酸扩增技术(iNAATs)结合以提高检测灵敏度。滚环扩增(RCA)作为一种突出的iNAAT,具有等温操作、扩增效率高、POC兼容性好等优势。

研究人员主要采用以下关键技术方法:磁纳米颗粒(MNP)用于靶标捕获和全血分离;构象锁定适配体设计包含内部夹板序列,靶标结合后暴露该序列以启动扩增;超分支滚环扩增(HRCA)通过两阶段扩增产生富含鸟嘌呤的DNA产物并形成G-四链体结构;G-四链体与血红素(hemin)结合形成过氧化物酶模拟物催化ABTS显色反应;三维打印便携式成像模块结合基于Python的图像处理流程提取RGB并转换为灰度值进行定量;TapeStation凝胶电泳验证扩增产物。

研究结果部分:

理论验证传感机制:研究人员使用NUPACK软件包模拟工程化适配体的折叠行为。无靶标时,适配体-夹板复合物保持闭合构象,poly-A(A8)间隔区减少空间位阻并实现高效的构象切换。夹板序列经BLAST验证与人基因组序列无匹配以避免交叉扩增。NUPACK模拟显示适配体与环形锁探针及引物混合物的预测最小自由能为-43.89 kcal/mol,表明强热力学稳定性。碱基配对概率图证实茎环区域的高稳定性,平衡浓度模拟显示完整三链HRCA启动复合物的平衡浓度超过300 nM,而非特异性相互作用极少。

HRCA扩增子形成的验证:研究人员通过凝胶电泳验证HRCA产物。锁探针与互补夹板寡核苷酸杂交后经T4 DNA连接酶连接形成环状DNA,再用核酸外切酶III处理去除线性DNA以确保特异性。TapeStation电泳显示,100 nM夹板存在时约300 bp处出现特征条带,证实环化成功;无夹板对照仅见约50 bp线性锁探针条带。HRCA阳性样品显示高分子量条带,电泳图谱揭示主要峰位于59,108 bp,而无CK-MB的阴性对照无扩增峰。5 ng/mL CK-MB即可诱导构象开关并启动HRCA,产生约15,000 bp条带。UV-vis光度法定量证实适配体成功偶联至MNP(初始260 ng/μL,偶联后上清降至75 ng/μL);HRCA引物可显著增强扩增效率。

检测灵敏度测定:研究人员评估了HRCA产生的血红素-G-四链体的过氧化物酶样活性。ABTS/H2O2体系中,G-四链体催化ABTS氧化产生绿色信号。自主开发的比色读数器采用三维打印不透光丙烯酸支架、LED背光面板、N52磁铁磁分离环及手动对焦网络摄像头,配合Python程序实时提取RGB值并转换为灰度值。水相样品中,CK-MB浓度0.5–100 ng/mL范围内,灰度强度与浓度呈负相关,240 s后出现明显信号变化;Δ灰度值随CK-MB浓度增加而降低,Student's t-test显示各浓度与对照组差异显著(p < 0.05, p < 0.01, p < 0.001)。校准曲线线性关系良好(R2 = 0.977),LOD为0.268 ng/mL,LOQ为0.89 ng/mL。研究人员优化了HRCA反应时间和锁探针浓度:固定10 nM锁探针时,45 min至4 h信号递增;为缩短检测时间,提高锁探针浓度至500 nM可将反应时间缩短至45 min且获得等效信号(灰度值70),UV-vis吸收值达0.77,各浓度间差异显著(P < 0.05至P < 0.001)。

血液样品分析:加血样品中CK-MB浓度0.5–100 ng/mL范围内同样呈现灰度值与浓度的负相关,Δ灰度值随浓度增加而降低(p < 0.01, p < 0.001)。校准曲线R2为0.895,LOD和LOQ分别为0.328 ng/mL和1.09 ng/mL。22份加血样品的回收率为100%–114%,相对标准偏差(RSD)为3.93%(n=3),表明良好精密度。特异性实验显示,肌红蛋白、cTnI和cTnT的Δ灰度值极低(约20),而CK-MB差异显著(约81,P < 0.001),证实检测的高特异性。

讨论与结论部分:研究人员总结建立了整合夹板辅助锁探针连接、HRCA和便携式比色读数器的快速集成工作流程。通过优化25°C、100 nM夹板浓度的连接条件提高环化效率。该检测方法在适当保存条件下(-20°C和4°C)关键组分可稳定保存一个月。与现有方法相比,该策略虽检测限在ng/mL范围,但与CK-MB临床相关浓度范围匹配;荧光或纳米材料辅助方法虽可达pg/mL级别,但涉及复杂仪器和多组分系统限制了实用性。与西门子、罗氏、雅培等商业平台(采用电化学发光、电化学检测、荧光免疫测定等技术)相比,本研究开发的HRCA比色检测LOD为0.328 ng/mL且无需额外仪器,可见读数产生时间小于2分钟,总检测时间45分钟。该平台具有核酸可编程性、便携性、全血兼容性和最小基础设施需求,可通过空间分离检测区域或采用不同显色底物系统扩展至cTnI、cTnT和肌红蛋白等多重心肌标志物检测。虽然该检测已在加血样品中验证,但尚需临床患者样品进一步验证以确立临床应用价值。

研究结论翻译:"总之,我们建立并验证了一种快速的CK-MB检测集成工作流程,结合了夹板辅助锁探针连接、超分支滚环扩增和便携式比色读数器。通过优化25°C下100 nM夹板浓度的连接条件提高了环化效率。比色反应使用ABTS/H2O2氧化进行,各颜色的RGB值使用比色读数器测量。该检测方法展现出优异的灵敏度,在水相和加血样品中的检出限分别为0.268和0.328 ng/mL,定量限分别为0.89和1.09 ng/mL。当关键组分在适当条件(-20和4°C)下储存时,检测方法在长达一个月内表现出稳定的性能。尽管已有基于适配体的生物传感器用于CK-MB、cTnI、cTnT和肌红蛋白等心脏标志物的检测,但许多现有方法依赖多步扩增策略或复杂的纳米材料辅助信号转导。近期研究展示了适配体与RCA在心脏标志物检测中的整合,包括CK-MB。此外,适配体-RCA平台已被广泛探索用于cTnI检测,基于荧光的方法可达到pg/mL范围的超低检测限。然而,这些系统通常涉及复杂的荧光仪器和多组分纳米材料系统,可能限制其实际应用性。相比之下,本工作介绍了一种基于锁定适配体的HRCA策略,在简化系统中实现靶标诱导激活和信号扩增。虽然检测限在ng/mL范围,但该灵敏度与CK-MB临床相关浓度范围良好匹配,使该检测方法适用于实际诊断应用。此外,HRCA的使用提供了增强的信号扩增效率,而锁定适配体设计提高了特异性,为心脏标志物检测提供了一个稳健且直接的平台。"
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