胶质母细胞瘤中神经肽Y信号传导的丧失与神经元向间充质细胞的转录转变相关:一项多尺度转录组分析
《International Journal of Molecular Sciences》:Loss of Neuropeptide Y Signaling Accompanies the Neural-to-Mesenchymal Transcriptional Transition in Glioblastoma: A Multi-Scale Transcriptomic Analysis
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时间:2026年07月07日
来源:International Journal of Molecular Sciences 5.6
摘要
神经肽Y [NPY;由NPY基因编码]是一种广泛存在的36氨基酸长的神经肽,可调节神经元功能、血管功能以及免疫功能;其在胶质母细胞瘤[GBM]中的作用至今尚未完全明确。我们采用了综合性的计算机模拟多尺度转录组分析方法,结合了TCGA数据库中IDH野生型GBM [n = 169]和低级别胶质瘤 [n = 510]的手术切除样本、GTEx数据库中的正常皮质组织 [n = 207],以及四个独立的GEO验证队列中的GBM手术样本和非肿瘤脑组织样本[包括GSE4290、GSE50161、GSE131928,这些数据为28名患者的约20,426个细胞的单细胞RNA测序结果;还有GSE194329,为5名患者的数据的10X Visium空间转录组学分析结果],同时还进行了生存分析、通路富集分析、单细胞RNA测序、空间转录组学分析以及细胞间通讯分析。在GBM中,NPY及其主要受体NPY1R的表达显著下降,而与缺氧、血管生成、侵袭及免疫抑制相关的基因则表达上升。单细胞分析显示,神经前体样细胞群中NPY相关基因的表达水平较高,而缺氧和代谢相关基因则主要存在于间质性肿瘤及基质区域,这说明不同细胞类型的生理环境存在差异。空间分析表明,NPY与缺氧状态之间的关系较为薄弱且不均匀,不同患者之间的差异较大,且不存在明显的整体空间相关性。这些研究结果说明,NPY信号通路的缺失是GBM的一个常见特征,且与缺氧驱动的肿瘤状态密切相关,而NPY与缺氧之间的空间关系则表现为较弱、不均匀,并且因患者而异。
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