多种基因组分析方法揭示了来自非洲之角和也门的入侵性斯氏按蚊的地理结构及局部选择信号

《BMC Genomics》：Multiple genomic approaches reveal geographic structure and local selection signals in invasive Anopheles stephensi from the Horn of Africa and Yemen

　　

摘要

背景

Anopheles stephensi是一种在非洲之角地区不断扩散的入侵性疟疾传播媒介，对公共卫生构成了日益严重的威胁。我们采用了多种基因组分析方法，包括全基因组测序（WGS）、双酶切限制性位点相关DNA测序（ddRAD）以及线粒体数据，以此来分析来自埃塞俄比亚、索马里兰和也门的An. stephensi种群与印度实验室培育种群的群体结构及适应性进化差异。

结果

全基因组测序显示常染色体上存在大规模的遗传差异，而使用更多样本（n?=?402）的ddRAD技术则能更精细地解析埃塞俄比亚和也门境内的亚群体结构，尤其是那些在入侵后疟疾发病率上升的地区。也门赛胡特地区的独特遗传组成表明An. stephensi内部存在隐性的遗传多样性。基于全基因组测序的分析在埃塞俄比亚种群中发现了编码酯酶、丝氨酸蛋白酶和脂肪酶同源物的基因位点存在选择清除现象，而在也门种群中则是在细胞色素P450基因簇处出现此类现象。

结论

这些研究结果有助于了解An. stephensi的遗传多样性，尤其是那些在入侵后疟疾高发地区的多样性情况。同时，它们也证明了结合全基因组测序和ddRAD技术是一种经济高效的方法，可用于分析媒介昆虫入侵时的群体结构并识别适应性基因位点。将这类基因组分析方法相结合，有助于更好地理解入侵动态，从而为城市化地区的疾病监测和针对性媒介控制提供依据。