基于激光微切割的多组学整合技术揭示了硬骨瘤型颅咽管瘤的病理图谱及肿瘤分化网络

《Acta Neuropathologica Communications》：Laser microdissection-based multi-omics integration unveils the pathological atlas and tumor differentiation network of adamantinomatous craniopharyngioma

　　

摘要

虽然牙釉质样颅咽管瘤在组织学上属于良性颅内肿瘤，但其具有指状突起的侵袭性生长模式，导致预后较差。深入分析该肿瘤病理结构的异质性以及肿瘤细胞的发育演变过程，对于制定更精准的治疗策略至关重要。然而，目前对于该肿瘤复杂病理结构特征的了解仍显不足。在此，我们通过激光微切割技术从6种不同的病理结构中获取40个样本，用于Smart-Seq2测序，并对6个单核RNA测序样本和4个空间转录组样本进行了深入分析。同时，我们还利用3个外部单细胞数据库进行了全面验证。通过组织病理学观察、多组学分析以及免疫荧光染色，我们明确了轮状细胞簇中两种不同功能亚群的单细胞表达特征，从而揭示了它们在肿瘤进展中的潜在生物学作用。此外，我们还发现了星状网状结构的上皮-间质转化现象或部分上皮-间质转化趋势，以及与终末角化相关的不同细胞命运。同时，我们还发现了此前未被重视的囊壁上皮以及构成性上皮。后者具有基底细胞的特征，可能作为维持和推动肿瘤发展的潜在祖细胞池。通过伪时间分析结合共表达网络分析，我们基于构成性上皮构建了一个分化调控网络。我们的研究结果补充了现有知识，为该肿瘤的病理特征提供了全面分析，也为精准靶向治疗带来了新的思路和靶点。